66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0680 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  593  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  82.56 
 
 		 258 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  67.95 
 
 		 289 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  65.86 
 
 		 262 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  64.78 
 
 		 256 aa  331  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  56.37 
 
 		 275 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  58.3 
 
 		 254 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  52.14 
 
 		 258 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  51.75 
 
 		 258 aa  263  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  57.89 
 
 		 257 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  52.33 
 
 		 259 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  49.39 
 
 		 255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  49.41 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  51 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  45.45 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  45.97 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  46.77 
 
 		 253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  43.87 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  43.36 
 
 		 264 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  42.63 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  36.77 
 
 		 312 aa  172  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  36.73 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  38.46 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  33.06 
 
 		 587 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  34.24 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  30.97 
 
 		 267 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  32.28 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  31.85 
 
 		 245 aa  112  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  30.31 
 
 		 245 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  31.2 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  30.8 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  30.43 
 
 		 247 aa  95.5  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  29.79 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  29.79 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  27.14 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  28.86 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  29.63 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  28.99 
 
 		 267 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  26.87 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  26.34 
 
 		 243 aa  53.5  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  25.1 
 
 		 277 aa  53.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  35.14 
 
 		 265 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  27.8 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  28.4 
 
 		 267 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  29.1 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6251  MOSC domain containing protein  32.97 
 
 		 233 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.364333  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  28.4 
 
 		 267 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  35.4 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1030  MOSC domain protein beta barrel domain protein  21.67 
 
 		 262 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  28.29 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  26.13 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4642  MOSC domain protein beta barrel domain protein  24.82 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.329604  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  28.45 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0033  MOSC domain containing protein  26.29 
 
 		 258 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0250865  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  36.73 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3425  MOSC domain protein beta barrel domain protein  23.11 
 
 		 263 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  24.35 
 
 		 366 aa  46.6  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0195  MOSC domain containing protein  26.9 
 
 		 266 aa  46.2  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0376  MOSC domain containing protein  22.77 
 
 		 263 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  25.64 
 
 		 283 aa  46.2  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0385  MOSC domain containing protein  22.77 
 
 		 263 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  27.6 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  26.48 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  26.49 
 
 		 259 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3365  MOSC domain-containing protein  24.01 
 
 		 302 aa  42.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0072  MOSC domain containing protein  26.98 
 
 		 259 aa  42.7  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>