59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2726 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
247 aa  493  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  99.19 
 
 
247 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  87.45 
 
 
247 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  48.37 
 
 
245 aa  217  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  47.58 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  48.43 
 
 
252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  44.72 
 
 
245 aa  198  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  37.8 
 
 
251 aa  149  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  36.36 
 
 
253 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  33.86 
 
 
289 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  32.13 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  31.62 
 
 
262 aa  115  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  30.8 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  31.89 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  28.74 
 
 
587 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  33.6 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  31.2 
 
 
292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  32.16 
 
 
275 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  28.63 
 
 
255 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  30.89 
 
 
256 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  30 
 
 
264 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  29.62 
 
 
264 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  32 
 
 
254 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  35.32 
 
 
288 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  30.95 
 
 
258 aa  99  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  29.39 
 
 
264 aa  98.6  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  32.41 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  30.04 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  29.29 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  27.02 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  31.89 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  25.95 
 
 
267 aa  93.2  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  30 
 
 
267 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  30 
 
 
267 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  28.4 
 
 
268 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  29.24 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  28.62 
 
 
268 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  29.2 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  32.35 
 
 
265 aa  56.6  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  33.81 
 
 
259 aa  55.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  29.43 
 
 
268 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  33.58 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  24.1 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  24.26 
 
 
302 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  27.71 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  24.26 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  36.97 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  34.23 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  21.86 
 
 
366 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  33.62 
 
 
291 aa  49.3  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  27.41 
 
 
283 aa  48.9  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2669  MOSC  33.85 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  34.09 
 
 
215 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  34.35 
 
 
264 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7473  hypothetical protein  30.48 
 
 
269 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427254 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  29.86 
 
 
272 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0195  MOSC domain containing protein  30.65 
 
 
266 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  24.56 
 
 
271 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  25.62 
 
 
616 aa  42.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.982432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>