58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5086 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
257 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  87.35 
 
 
254 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  66.27 
 
 
258 aa  335  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  67.07 
 
 
259 aa  334  7.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  65.86 
 
 
258 aa  328  4e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  66.01 
 
 
256 aa  322  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  54.55 
 
 
256 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  58.7 
 
 
258 aa  270  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  56.45 
 
 
262 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  55.81 
 
 
289 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  57.38 
 
 
292 aa  257  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  53.63 
 
 
255 aa  249  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  52.76 
 
 
276 aa  247  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  51.41 
 
 
275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  48.62 
 
 
253 aa  222  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  47.01 
 
 
253 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  46.06 
 
 
264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  46.06 
 
 
264 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  45.49 
 
 
264 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  42.36 
 
 
312 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  43.43 
 
 
251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  43.8 
 
 
258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  44.57 
 
 
288 aa  178  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  34.63 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  29.84 
 
 
587 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  34.52 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  34.52 
 
 
249 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  32.82 
 
 
245 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  29.43 
 
 
267 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  28.21 
 
 
302 aa  85.9  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  28.21 
 
 
302 aa  85.9  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  29.08 
 
 
247 aa  85.5  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  32.41 
 
 
247 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  31.52 
 
 
247 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  28.4 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  28.57 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  26.25 
 
 
268 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  30.29 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  29.46 
 
 
267 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  28.87 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  25.51 
 
 
269 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  27.44 
 
 
283 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0033  MOSC domain containing protein  26.27 
 
 
258 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0250865  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  30.43 
 
 
366 aa  50.1  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  35.11 
 
 
267 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  35.11 
 
 
267 aa  48.9  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  25.2 
 
 
269 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  27.31 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  26.54 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0072  MOSC domain containing protein  28.31 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  26.84 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  40 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  27.59 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1690  MOSC domain containing protein  32.43 
 
 
143 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  31.4 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  27.74 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0270  MOSC domain-containing protein  27.74 
 
 
290 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3900  Fe-S protein-like protein  32.12 
 
 
247 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  0.478822 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>