69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2591 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5021  MOSC domain-containing protein  39.35 
 
 
347 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4727  MOSC domain-containing protein  39.41 
 
 
318 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4639  MOSC domain-containing protein  39.41 
 
 
318 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4067  MOSC domain containing protein  31.76 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  34.17 
 
 
237 aa  109  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5393  MOSC domain-containing protein  32.07 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5304  MOSC domain-containing protein  32.07 
 
 
274 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5683  MOSC domain-containing protein  31.38 
 
 
274 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  27.34 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  27.82 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  28.45 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  25.99 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  23.84 
 
 
255 aa  59.3  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  30.66 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  27.53 
 
 
267 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  26.41 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  27.24 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  25.27 
 
 
258 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  30.88 
 
 
264 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  26.39 
 
 
245 aa  55.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  27.7 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  25.86 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6251  MOSC domain containing protein  36.84 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.364333  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  25.37 
 
 
269 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  27.53 
 
 
267 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  27.18 
 
 
292 aa  52.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  25.43 
 
 
367 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  27.18 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  24.91 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  27.59 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  25.85 
 
 
369 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  28.57 
 
 
275 aa  49.3  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  25.86 
 
 
370 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  25.85 
 
 
369 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  25.85 
 
 
369 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  25.85 
 
 
369 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2669  MOSC  26.67 
 
 
266 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  25.86 
 
 
370 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  26.19 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  27.68 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  25.09 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  25.95 
 
 
258 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  23.73 
 
 
369 aa  48.1  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  25.44 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7473  hypothetical protein  24.72 
 
 
269 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  25.62 
 
 
289 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  22.33 
 
 
587 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  21.41 
 
 
302 aa  45.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  21.41 
 
 
302 aa  45.8  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2174  MOSC domain-containing protein  24.73 
 
 
280 aa  46.2  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.160462 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  23.02 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  31.03 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  27.59 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1533  MOSC domain-containing protein  27.97 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.134662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1002  MOSC domain-containing protein  29.39 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  26.9 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  26.8 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3900  Fe-S protein-like protein  23 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3776  MOSC domain-containing protein  23.61 
 
 
275 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  29.91 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  32.98 
 
 
215 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  50 
 
 
267 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  24.41 
 
 
367 aa  42.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  24.29 
 
 
259 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  24.66 
 
 
371 aa  42.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1126  MOSC-like beta barrel  47.37 
 
 
301 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  24.65 
 
 
258 aa  42  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>