111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0045 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  100 
 
 		 237 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  34.17 
 
 		 283 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5021  MOSC domain-containing protein  33.7 
 
 		 347 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4639  MOSC domain-containing protein  33.83 
 
 		 318 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4727  MOSC domain-containing protein  33.83 
 
 		 318 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  32.14 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  30 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1825  MOSC domain containing protein  29.48 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6251  MOSC domain containing protein  33.2 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.364333  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4067  MOSC domain containing protein  30.9 
 
 		 326 aa  75.1  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5304  MOSC domain-containing protein  32.46 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5393  MOSC domain-containing protein  32.46 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  29.1 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  28.68 
 
 		 367 aa  72.4  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  33.61 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5683  MOSC domain-containing protein  32.46 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  31.13 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  30.22 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  28.74 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  27.69 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  29.73 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  29.78 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  31.84 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  29.63 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  32.35 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  29.15 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  30.04 
 
 		 268 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  28.57 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  27.9 
 
 		 370 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  27.9 
 
 		 370 aa  65.5  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  27.84 
 
 		 367 aa  65.1  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  28.63 
 
 		 269 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  27.9 
 
 		 369 aa  65.1  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2174  MOSC domain-containing protein  25.75 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.160462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1456  hypothetical protein  27.85 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.471976  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  27.21 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  30.32 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  30.64 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0697  MOSC domain-containing protein  30.7 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.722913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1157  MOSC domain containing protein  27.62 
 
 		 285 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  27.5 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1005  MOSC domain protein beta barrel domain protein  27.12 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0446745  normal  0.3827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1002  MOSC domain-containing protein  28.87 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.349184  normal  0.14214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  27.23 
 
 		 258 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  29.96 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  27.48 
 
 		 616 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  25.99 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  27.13 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3189  MOSC domain protein beta barrel domain protein  30.57 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0270  MOSC domain-containing protein  29.91 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184524 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  26.16 
 
 		 605 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  24.63 
 
 		 587 aa  55.1  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  29.77 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  30.35 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  25.87 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  26.69 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  24 
 
 		 662 aa  54.7  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  26.62 
 
 		 369 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  29.89 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4182  MOSC domain containing protein  30.69 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1596  MOSC domain-containing protein  22.34 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  26.92 
 
 		 369 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  26.92 
 
 		 369 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  26.92 
 
 		 369 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  26.92 
 
 		 369 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  26.62 
 
 		 369 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  26.62 
 
 		 369 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  30.34 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  26.92 
 
 		 369 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  30.04 
 
 		 245 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1533  MOSC domain-containing protein  43.66 
 
 		 288 aa  52.4  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134662 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  26.7 
 
 		 367 aa  52  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3900  Fe-S protein-like protein  31.58 
 
 		 247 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  26.47 
 
 		 371 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  25.86 
 
 		 369 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0376  MOSC domain containing protein  24.14 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0385  MOSC domain containing protein  24.14 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  28.46 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  42.55 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  25.09 
 
 		 605 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0416  putative ferredoxin  24.34 
 
 		 390 aa  49.7  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3425  MOSC domain protein beta barrel domain protein  26.48 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  27.86 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7473  hypothetical protein  24.22 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427254 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  30.28 
 
 		 271 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  28.52 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  25.86 
 
 		 369 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  26.24 
 
 		 369 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2173  MOSC domain containing protein  29.41 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.470519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  28.23 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  25.86 
 
 		 369 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  25.86 
 
 		 369 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0141  MOSC domain containing protein  25.93 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  24.71 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  25.86 
 
 		 369 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2669  MOSC  29.49 
 
 		 266 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0886  MOSC domain-containing protein  28.44 
 
 		 289 aa  45.4  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0982763  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3067  hypothetical protein  39.36 
 
 		 183 aa  45.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190336  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  28.52 
 
 		 258 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>