34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4067 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4067  MOSC domain containing protein  100 
 
 
326 aa  642    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5021  MOSC domain-containing protein  46.91 
 
 
347 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4727  MOSC domain-containing protein  46.49 
 
 
318 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4639  MOSC domain-containing protein  46.49 
 
 
318 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  31.76 
 
 
283 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5683  MOSC domain-containing protein  33.01 
 
 
274 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5393  MOSC domain-containing protein  33.55 
 
 
274 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5304  MOSC domain-containing protein  33.55 
 
 
274 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  25.51 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  30.9 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  29.32 
 
 
265 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  29.75 
 
 
243 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  25.65 
 
 
268 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10746  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G07820)  35.96 
 
 
419 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.673358  normal  0.446877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  35.37 
 
 
268 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3900  Fe-S protein-like protein  28.12 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  35.16 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  42.86 
 
 
268 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  25.1 
 
 
268 aa  47  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  32.74 
 
 
215 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  25.97 
 
 
269 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  25.73 
 
 
267 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  29.75 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  26.27 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  23.67 
 
 
277 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  26.67 
 
 
258 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  23.94 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  24.02 
 
 
267 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  33.33 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  25.88 
 
 
267 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06729  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05900)  28.23 
 
 
478 aa  43.5  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1157  MOSC domain containing protein  27.78 
 
 
285 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  26.89 
 
 
259 aa  42.4  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  29.46 
 
 
245 aa  42.4  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>