98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3900 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3900  Fe-S protein-like protein  100 
 
 
247 aa  490  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  30 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  30.43 
 
 
238 aa  75.1  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  29.79 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  29.31 
 
 
268 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1679  MOSC domain containing protein  28.83 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.65399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  31.33 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  31.87 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6251  MOSC domain containing protein  31.88 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.364333  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4133  MOSC domain containing protein  26.37 
 
 
293 aa  68.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.249297 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  28.33 
 
 
269 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2642  MOSC domain-containing protein  27.97 
 
 
369 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.577496  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1986  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  28.47 
 
 
370 aa  67  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2553  MOSC/iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  28.47 
 
 
370 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  27.74 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  28.63 
 
 
267 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1459  MOSC domain-containing protein  28.57 
 
 
371 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0439261  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  28.82 
 
 
367 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  28.76 
 
 
268 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  30.91 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1061  MOSC domain-containing protein  27.73 
 
 
369 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000142563  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1122  MOSC domain protein  27.8 
 
 
369 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00459841  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1018  MOSC domain protein  27.8 
 
 
369 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000580414  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1169  MOSC domain-containing protein  27.8 
 
 
369 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00214558  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1101  MOSC domain protein  27.8 
 
 
369 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0241324  normal  0.840563 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1056  MOSC domain-containing protein  27.73 
 
 
369 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000706044  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1135  MOSC domain-containing protein  27.8 
 
 
369 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00343917  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2371  MOSC domain protein  27.73 
 
 
369 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159544  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2649  MOSC domain-containing protein  27.73 
 
 
369 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0311514  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2696  MOSC domain containing protein  27.73 
 
 
369 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000191244  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00951  predicted 2Fe-2S cluster-containing protein  27.73 
 
 
369 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000186571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00958  hypothetical protein  27.73 
 
 
369 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000157024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  26.24 
 
 
367 aa  60.8  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1110  MOSC domain protein  27.31 
 
 
369 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000289378  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1648  MOSC domain containing protein  28.11 
 
 
367 aa  60.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  30.47 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1790  MOSC domain containing protein  26.95 
 
 
367 aa  60.1  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2173  MOSC domain-containing protein  27.31 
 
 
369 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000104481  normal  0.521589 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5021  MOSC domain-containing protein  31.82 
 
 
347 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3078  MOSC domain containing protein  25.09 
 
 
287 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.558728 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0270  MOSC domain-containing protein  32.2 
 
 
290 aa  58.5  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.184524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4639  MOSC domain-containing protein  32.03 
 
 
318 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4727  MOSC domain-containing protein  32.03 
 
 
318 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5683  MOSC domain-containing protein  27.31 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2174  MOSC domain-containing protein  24.54 
 
 
280 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.160462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1030  MOSC domain protein beta barrel domain protein  25.66 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321226 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  30.52 
 
 
253 aa  56.6  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2402  MOSC domain-containing protein  28.74 
 
 
289 aa  57  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5393  MOSC domain-containing protein  26.94 
 
 
274 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5304  MOSC domain-containing protein  26.94 
 
 
274 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3619  MOSC domain-containing protein  29.37 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  38.52 
 
 
291 aa  54.7  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  28.57 
 
 
277 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2929  MOSC domain protein beta barrel domain protein  29.37 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3506  MOSC domain protein beta barrel domain protein  27.61 
 
 
314 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.28145  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4642  MOSC domain protein beta barrel domain protein  29.49 
 
 
311 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.329604  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  36.55 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0072  MOSC domain containing protein  29.13 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3189  MOSC domain protein beta barrel domain protein  28.45 
 
 
184 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  27.59 
 
 
267 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0122  MOSC  25.45 
 
 
262 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  22.99 
 
 
366 aa  52.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  31.58 
 
 
237 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3776  MOSC domain-containing protein  23.57 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  31.82 
 
 
283 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0141  MOSC domain containing protein  24.15 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  26.64 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1005  MOSC domain protein beta barrel domain protein  29.07 
 
 
285 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0446745  normal  0.3827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  26.25 
 
 
262 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0416  putative ferredoxin  23.61 
 
 
390 aa  48.9  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1596  MOSC domain-containing protein  21.55 
 
 
264 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0465  MOSC domain-containing protein  29.06 
 
 
290 aa  48.5  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  26.72 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4067  MOSC domain containing protein  27.62 
 
 
326 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3365  MOSC domain-containing protein  27.12 
 
 
302 aa  48.1  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  29.32 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1126  MOSC-like beta barrel  26.72 
 
 
301 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1980  MOSC domain protein beta barrel domain protein  29.11 
 
 
291 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.446271  normal  0.886457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1157  MOSC domain containing protein  29.52 
 
 
285 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  26.29 
 
 
267 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  28 
 
 
616 aa  46.6  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  29.41 
 
 
272 aa  45.8  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  28.57 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2173  MOSC domain containing protein  35.64 
 
 
293 aa  45.8  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.470519  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0337  MOSC domain containing protein  26.03 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  29.3 
 
 
258 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  22.74 
 
 
605 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  29.69 
 
 
258 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  33.64 
 
 
276 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  23 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2217  hypothetical protein  28.57 
 
 
291 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704942  hitchhiker  0.00711608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  29.89 
 
 
264 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  28.91 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  25.98 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  26.61 
 
 
264 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  32.12 
 
 
257 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  25.3 
 
 
292 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  29.89 
 
 
264 aa  42  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0438681 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>