53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3189 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3189  MOSC domain protein beta barrel domain protein  100 
 
 		 184 aa  355  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3067  hypothetical protein  38.42 
 
 		 183 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190336  normal  0.120056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  30.57 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1533  MOSC domain-containing protein  49.12 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  26.96 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3900  Fe-S protein-like protein  29 
 
 		 247 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2634  hypothetical protein  33.73 
 
 		 616 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.982432 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0315  hypothetical protein  27.73 
 
 		 662 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  36.67 
 
 		 267 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  36.67 
 
 		 267 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  27.18 
 
 		 268 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5021  MOSC domain-containing protein  42.37 
 
 		 347 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  44.44 
 
 		 271 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0886  MOSC domain-containing protein  39.71 
 
 		 289 aa  47.8  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0982763  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4642  MOSC domain protein beta barrel domain protein  45.61 
 
 		 311 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.329604  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0465  MOSC domain-containing protein  44.83 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  36.67 
 
 		 267 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4727  MOSC domain-containing protein  43.14 
 
 		 318 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1126  MOSC-like beta barrel  44.83 
 
 		 301 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4639  MOSC domain-containing protein  43.14 
 
 		 318 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1825  MOSC domain containing protein  37.5 
 
 		 276 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001340  ferredoxin-NADPH reductase  22.52 
 
 		 605 aa  45.4  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2669  MOSC  38.24 
 
 		 266 aa  45.8  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7473  hypothetical protein  42.37 
 
 		 269 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5683  MOSC domain-containing protein  26.1 
 
 		 274 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3268  MOSC domain-containing protein  34.38 
 
 		 288 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545549 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3619  MOSC domain-containing protein  42.11 
 
 		 289 aa  44.7  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2929  MOSC domain protein beta barrel domain protein  42.11 
 
 		 289 aa  44.7  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  36.36 
 
 		 267 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  36.73 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05229  ferredoxin/oxidoreductase  23.75 
 
 		 605 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4341  MOSC domain-containing protein  37.14 
 
 		 314 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  36.73 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5304  MOSC domain-containing protein  25.74 
 
 		 274 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  28.32 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4249  MOSC domain-containing protein  34.38 
 
 		 288 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.270492  normal  0.0898326 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1596  MOSC domain-containing protein  22.58 
 
 		 264 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4117  MOSC-like beta barrel  34.38 
 
 		 288 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5393  MOSC domain-containing protein  25.74 
 
 		 274 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  40.82 
 
 		 277 aa  42.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3365  MOSC domain-containing protein  41.38 
 
 		 302 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2402  MOSC domain-containing protein  41.82 
 
 		 289 aa  42.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  42.11 
 
 		 264 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03942  MOSC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08160)  27.54 
 
 		 367 aa  42  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  44.83 
 
 		 291 aa  42  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1762  uncharacterized Fe-S protein  31.25 
 
 		 288 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  23.51 
 
 		 249 aa  41.6  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2217  hypothetical protein  37.5 
 
 		 291 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.704942  hitchhiker  0.00711608 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2063  MOSC domain containing protein  23.61 
 
 		 367 aa  41.6  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  27.61 
 
 		 255 aa  41.2  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  31.75 
 
 		 283 aa  41.2  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0141  MOSC domain containing protein  37.04 
 
 		 263 aa  40.8  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1742  MOSC domain-containing protein  34.15 
 
 		 367 aa  40.8  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191125  normal  0.0117545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>