66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5445 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  100 
 
 
256 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  70.36 
 
 
258 aa  347  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  69.96 
 
 
259 aa  343  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  69.57 
 
 
258 aa  341  8e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  66.01 
 
 
257 aa  322  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  61.51 
 
 
254 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  53.85 
 
 
256 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  49.8 
 
 
262 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  50.61 
 
 
258 aa  227  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  51.01 
 
 
255 aa  227  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  48.99 
 
 
289 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  50.81 
 
 
292 aa  227  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  45.78 
 
 
276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  45.38 
 
 
275 aa  199  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  44.13 
 
 
253 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  41.7 
 
 
251 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  42.25 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  42.19 
 
 
253 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  40.93 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  40.55 
 
 
264 aa  162  7e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  39.15 
 
 
258 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  34.97 
 
 
312 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  41.63 
 
 
288 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  35.66 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  31.13 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  31.33 
 
 
245 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  28.4 
 
 
245 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  31.6 
 
 
247 aa  102  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  29.75 
 
 
302 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  29.75 
 
 
302 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  29.88 
 
 
587 aa  99.4  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  30.89 
 
 
247 aa  95.5  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  30.49 
 
 
247 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  27.82 
 
 
267 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  28.11 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  28.45 
 
 
265 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  27.69 
 
 
267 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3296  MOSC:MOSC, N-terminal beta barrel  26.78 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  28.46 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  28.21 
 
 
267 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  25.2 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  27.03 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  26.69 
 
 
268 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  28.15 
 
 
267 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  27.73 
 
 
267 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  25.62 
 
 
268 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0385  MOSC domain containing protein  23.59 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0589  hypothetical protein  25.21 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0376  MOSC domain containing protein  23.59 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  28.21 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  30.82 
 
 
271 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0115  MOSC domain-containing protein  28.46 
 
 
366 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.84635 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3013  MOSC domain containing protein  28.19 
 
 
267 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00109789  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  26 
 
 
268 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3425  MOSC domain protein beta barrel domain protein  24.63 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1533  MOSC domain-containing protein  40.68 
 
 
288 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.134662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1030  MOSC domain protein beta barrel domain protein  21.51 
 
 
262 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321226 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  28.02 
 
 
277 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0033  MOSC domain containing protein  27.73 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0250865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  25.5 
 
 
215 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0072  MOSC domain containing protein  27.27 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3900  Fe-S protein-like protein  28.91 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5016  flavodoxin reductase family 1 protein  30.23 
 
 
264 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.77212  normal  0.224749 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  27.52 
 
 
237 aa  42.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7473  hypothetical protein  23.28 
 
 
269 aa  42.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1762  uncharacterized Fe-S protein  25 
 
 
288 aa  42  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>