63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4096 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  81.78 
 
 		 262 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  75.5 
 
 		 256 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  67.95 
 
 		 292 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  67.59 
 
 		 258 aa  352  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  61.24 
 
 		 275 aa  324  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  58.8 
 
 		 254 aa  278  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  54.29 
 
 		 255 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  52.76 
 
 		 258 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  53.15 
 
 		 258 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  55.81 
 
 		 257 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  53.33 
 
 		 259 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  49.41 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  48.61 
 
 		 253 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  50.6 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  47.01 
 
 		 264 aa  228  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  46.25 
 
 		 264 aa  228  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  48.99 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  46.3 
 
 		 264 aa  225  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  48.78 
 
 		 253 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  44.35 
 
 		 251 aa  203  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  40.16 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  38.35 
 
 		 312 aa  185  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  35.71 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  34.54 
 
 		 245 aa  135  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  33.74 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  35.34 
 
 		 587 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  36.36 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0878  MOSC domain-containing protein  32.13 
 
 		 252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2726  MOSC domain-containing protein  34.14 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.06884 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2868  MOSC domain-containing protein  31.45 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  29.39 
 
 		 302 aa  93.6  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  29.39 
 
 		 302 aa  93.6  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0045  MOSC domain protein beta barrel domain protein  27.5 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2916  MOSC domain containing protein  30.51 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3425  MOSC domain protein beta barrel domain protein  23.93 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.648201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  27.01 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0033  MOSC domain containing protein  27.44 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0250865  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0072  MOSC domain containing protein  28.97 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  25.1 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  36.49 
 
 		 265 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  34.51 
 
 		 267 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1152  MOSC domain containing protein  35.16 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3791  MOSC domain containing protein  25.54 
 
 		 215 aa  49.3  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2364  hypothetical protein  27.75 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000594582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1030  MOSC domain protein beta barrel domain protein  21.63 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00321226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4451  MOSC domain-containing protein  28.41 
 
 		 238 aa  47  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  25.62 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2136  hypothetical protein  33.63 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.363257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1573  MOSC domain-containing protein  26.78 
 
 		 268 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5683  MOSC domain-containing protein  28.46 
 
 		 274 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22010  uncharacterized Fe-S protein  26.88 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00891318  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4182  MOSC domain containing protein  26.36 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.440376  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  34.25 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0376  MOSC domain containing protein  21.52 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  30.97 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0385  MOSC domain containing protein  21.52 
 
 		 263 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5393  MOSC domain-containing protein  27.64 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5304  MOSC domain-containing protein  27.64 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24980  hypothetical protein  27.42 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1112  MOSC domain-containing protein  34.41 
 
 		 272 aa  42.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.955874 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1456  hypothetical protein  34.94 
 
 		 283 aa  42.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.471976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>