42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48037 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_48037  predicted protein  100 
 
 
302 aa  624  1e-178  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0645802  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49807  predicted protein  99.67 
 
 
302 aa  622  1e-177  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.642974  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1750  MOSC domain-containing protein  31.11 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.340941  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5445  MOSC domain-containing protein  29.75 
 
 
256 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4922  MOSC domain containing protein  29.03 
 
 
262 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440017  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2624  MOSC domain containing protein  30.47 
 
 
264 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0438681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2301  MOSC domain containing protein  28.32 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.286975  normal  0.0755374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4248  MOSC  28.78 
 
 
256 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13041  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4096  hypothetical protein  29.39 
 
 
289 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.496795  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1194  hypothetical protein  26.86 
 
 
275 aa  93.2  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.102513  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2344  MOSC domain-containing protein  29.09 
 
 
258 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.451326  normal  0.65259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2345  MOSC domain-containing protein  30.66 
 
 
264 aa  92  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  0.379327 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5382  MOSC domain containing protein  28.1 
 
 
254 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.986245  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2300  MOSC domain containing protein  27.74 
 
 
259 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.913234  normal  0.11176 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0588  hypothetical protein  29.24 
 
 
258 aa  90.1  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488276  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2035  oxidoreductase, FAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  30 
 
 
587 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0495078  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2623  MOSC domain containing protein  28.1 
 
 
258 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.06387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1901  MOSC domain-containing protein  28.62 
 
 
276 aa  89  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1824  MOSC domain-containing protein  29.35 
 
 
253 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4576  MOSC domain-containing protein  28.07 
 
 
267 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0680  hypothetical protein  29.35 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0943778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5086  MOSC domain-containing protein  28.21 
 
 
257 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0649  MOSC domain-containing protein  28.67 
 
 
251 aa  85.5  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.397227  normal  0.255318 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6353  MOSC domain containing protein  26.45 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0984  MOSC domain-containing protein  26.02 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.734276  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1219  MOSC domain containing protein  27.8 
 
 
288 aa  72.4  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351072  normal  0.014657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7245  MOSC domain-containing protein  25.83 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.373711  normal  0.311801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0306  MOSC domain-containing protein  25.98 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685583  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0327  MOSC domain protein  25.91 
 
 
249 aa  67  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.737699  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0636  MOSC  24.54 
 
 
245 aa  62.8  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3953  MOSC  23.26 
 
 
268 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136601  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1110  hypothetical protein  24.64 
 
 
243 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841681  hitchhiker  0.000153585 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1139  MOSC domain-containing protein  24.07 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1647  MOSC domain-containing protein  23.43 
 
 
267 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3523  MOSC domain protein  23.47 
 
 
269 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0765095  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1671  MOSC domain-containing protein  23.71 
 
 
267 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.652631  normal  0.620994 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2591  hypothetical protein  21.41 
 
 
283 aa  45.8  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1456  hypothetical protein  27.92 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.471976  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18206  predicted protein  23.82 
 
 
342 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.602779  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3611  MOSC domain-containing protein  31.75 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243105  normal  0.211141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2129  MOSC domain containing protein  31.75 
 
 
267 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1065  hypothetical protein  24.63 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>