More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND02420 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06651  mRNA-nucleus export ATPase (Elf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03580)  40.81 
 
 		 1118 aa  681    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06700  elongation factor 3 (Eurofung)  48.99 
 
 		 917 aa  829    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.617822 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45865  predicted protein  42.18 
 
 		 923 aa  675    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.80899  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00950  mRNA export factor elf1, putative  39.61 
 
 		 1100 aa  664    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.484404  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02420  elongation factor 3  100 
 
 		 1055 aa  2164    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.103235  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89073  predicted protein  43.79 
 
 		 1031 aa  740    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161283  normal  0.722598 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90176  translation elongation factor  46.3 
 
 		 1048 aa  858    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.902447  normal  0.536047 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27838  predicted protein  43.1 
 
 		 1040 aa  687    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88728  predicted protein  37.17 
 
 		 1141 aa  617  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal  0.12515 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36160  predicted protein  33.68 
 
 		 995 aa  523  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9372  predicted protein  42.94 
 
 		 504 aa  402  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35279  predicted protein  39.66 
 
 		 528 aa  362  3e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  31.31 
 
 		 521 aa  188  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  31.74 
 
 		 557 aa  173  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  30.5 
 
 		 751 aa  169  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  28.5 
 
 		 533 aa  169  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  29.13 
 
 		 625 aa  165  5.0000000000000005e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  29.41 
 
 		 654 aa  164  6e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  29.59 
 
 		 527 aa  164  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  29.38 
 
 		 623 aa  160  9e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  29.15 
 
 		 609 aa  159  3e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  30 
 
 		 645 aa  159  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  29.21 
 
 		 610 aa  157  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41659  predicted protein  30.22 
 
 		 645 aa  155  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.666462  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1833  hypothetical protein  30.71 
 
 		 616 aa  154  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  30.15 
 
 		 625 aa  154  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2041  ABC transporter related  30.84 
 
 		 651 aa  154  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  29.44 
 
 		 692 aa  154  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  29.21 
 
 		 642 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  28.57 
 
 		 672 aa  152  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1376  ABC transporter ATP-binding protein  29.02 
 
 		 676 aa  152  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636737  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1830  hypothetical protein  30.71 
 
 		 616 aa  152  4e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  28.75 
 
 		 625 aa  152  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  28.88 
 
 		 645 aa  151  5e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  26.94 
 
 		 635 aa  151  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21470  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  28.24 
 
 		 529 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  31.2 
 
 		 656 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  30.14 
 
 		 635 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  29.7 
 
 		 636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0743  ABC transporter related  24.35 
 
 		 625 aa  150  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0760  ABC transporter related  24.35 
 
 		 625 aa  150  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0383  ABC transporter, ATP-binding protein  24.51 
 
 		 627 aa  149  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.386036  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 		 651 aa  149  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  28.18 
 
 		 633 aa  149  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44942  predicted protein  36.57 
 
 		 556 aa  149  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  28.17 
 
 		 633 aa  148  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.97 
 
 		 640 aa  148  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.97 
 
 		 640 aa  148  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  29.66 
 
 		 650 aa  148  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.97 
 
 		 640 aa  148  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  28 
 
 		 622 aa  148  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  28.47 
 
 		 615 aa  148  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  28.99 
 
 		 636 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  29.02 
 
 		 643 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  29.02 
 
 		 618 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3138  ABC transporter related  27.09 
 
 		 621 aa  147  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00577211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  30.22 
 
 		 637 aa  148  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  30.22 
 
 		 637 aa  148  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2068  ABC transporter related  27.63 
 
 		 643 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02335  ABC transporter ATPase component  29.62 
 
 		 639 aa  147  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  28.47 
 
 		 615 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  30.22 
 
 		 637 aa  147  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2600  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 646 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0562857  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  28.54 
 
 		 637 aa  147  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0238  ABC transporter related  29.68 
 
 		 625 aa  146  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.773221  normal  0.692019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 		 635 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2511  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 646 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.271255  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2455  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 646 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242369  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68683  ATP-binding cassette (ABC) family, regulator of translational elongation  29 
 
 		 752 aa  146  2e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  29.15 
 
 		 627 aa  146  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  28.05 
 
 		 657 aa  146  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  30.22 
 
 		 636 aa  146  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  29.1 
 
 		 640 aa  146  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  29.77 
 
 		 627 aa  146  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  27.18 
 
 		 630 aa  145  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2055  ABC transporter related  28.36 
 
 		 643 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.035925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  30.22 
 
 		 637 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  27.76 
 
 		 646 aa  145  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 		 635 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  30.22 
 
 		 637 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  29.43 
 
 		 638 aa  145  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6041  ABC transporter related  28.36 
 
 		 643 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 		 635 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  30.22 
 
 		 637 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 		 635 aa  145  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2036  ABC transporter related  28.36 
 
 		 643 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252943  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  28.89 
 
 		 657 aa  145  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  29.17 
 
 		 634 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.06 
 
 		 635 aa  145  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  29.98 
 
 		 637 aa  145  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_81  predicted protein  33.77 
 
 		 1330 aa  145  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.267422 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  28.91 
 
 		 624 aa  144  7e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  28.75 
 
 		 636 aa  144  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2480  ABC transporter-related protein  29.95 
 
 		 676 aa  144  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404041  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  31.14 
 
 		 732 aa  144  8e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5345  ABC transporter, fused ATPase subunits  27.1 
 
 		 643 aa  144  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1572  ABC transporter, ATP-binding protein  29.44 
 
 		 646 aa  144  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.50284  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1347  ABC transporter, ATP-binding protein  29.44 
 
 		 646 aa  144  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2075  ABC transporter, ATP-binding protein  29.44 
 
 		 646 aa  144  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.491633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3237  ABC transporter, ATP-binding protein  29.44 
 
 		 646 aa  144  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>