More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_10367 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  100 
 
 		 527 aa  1092    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  44.78 
 
 		 751 aa  448  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68683  ATP-binding cassette (ABC) family, regulator of translational elongation  44.8 
 
 		 752 aa  444  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525981  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  42.21 
 
 		 732 aa  423  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  38.87 
 
 		 631 aa  403  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41659  predicted protein  38.26 
 
 		 645 aa  383  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.666462  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  39.02 
 
 		 521 aa  372  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  40.27 
 
 		 625 aa  371  1e-101  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  37.88 
 
 		 645 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  37.36 
 
 		 615 aa  363  4e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  39.2 
 
 		 623 aa  362  7.0000000000000005e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  35.92 
 
 		 627 aa  360  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  38.52 
 
 		 610 aa  358  1.9999999999999998e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  36.17 
 
 		 629 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  36.6 
 
 		 627 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  37.05 
 
 		 627 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  36.86 
 
 		 633 aa  354  2e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  36.7 
 
 		 557 aa  352  1e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  38.14 
 
 		 637 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  38.1 
 
 		 609 aa  350  5e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  36.81 
 
 		 625 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  37.23 
 
 		 615 aa  350  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  37.23 
 
 		 615 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  35.54 
 
 		 627 aa  348  9e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89200  predicted protein  36.25 
 
 		 685 aa  348  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.564175 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  37.04 
 
 		 642 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  35.54 
 
 		 640 aa  348  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  35.69 
 
 		 636 aa  344  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  37.74 
 
 		 615 aa  343  4e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4782  ABC transporter related  37.64 
 
 		 620 aa  342  7e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.27 
 
 		 635 aa  342  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  35.19 
 
 		 630 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.08 
 
 		 635 aa  340  4e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  35.88 
 
 		 636 aa  340  4e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  36.11 
 
 		 639 aa  340  5e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  35.5 
 
 		 657 aa  340  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  36.53 
 
 		 627 aa  339  5.9999999999999996e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  36.45 
 
 		 637 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  36.45 
 
 		 637 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  36.23 
 
 		 625 aa  339  7e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  36.96 
 
 		 618 aa  339  8e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4634  ABC transporter related  37.07 
 
 		 621 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  36.26 
 
 		 637 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4267  ABC transporter related  36.88 
 
 		 621 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183783  normal  0.517303 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  35.69 
 
 		 636 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  38.98 
 
 		 533 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  35.88 
 
 		 637 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  35.88 
 
 		 637 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  35.88 
 
 		 637 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 637 aa  336  5e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  35.31 
 
 		 656 aa  336  5e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  35.88 
 
 		 637 aa  336  7e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  36.42 
 
 		 625 aa  335  1e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.46 
 
 		 640 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.46 
 
 		 640 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.46 
 
 		 640 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.71 
 
 		 637 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  35.97 
 
 		 625 aa  333  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  35.93 
 
 		 636 aa  333  4e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  35.45 
 
 		 624 aa  333  5e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  36.02 
 
 		 635 aa  333  6e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  36.86 
 
 		 642 aa  332  9e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  37.57 
 
 		 621 aa  332  1e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2317  ABC transporter related  36.93 
 
 		 627 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  36.47 
 
 		 625 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0048  ABC transporter related  33.71 
 
 		 664 aa  331  2e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2962  ABC transporter related  36.84 
 
 		 619 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0574525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  35.11 
 
 		 650 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  36.35 
 
 		 657 aa  329  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 		 638 aa  329  7e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3118  ABC transporter related  36.17 
 
 		 631 aa  329  7e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0972  ABC transporter related  37.38 
 
 		 626 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  35.22 
 
 		 643 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  35.11 
 
 		 635 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0238  ABC transporter related  36.81 
 
 		 625 aa  327  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.773221  normal  0.692019 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14998  predicted protein  37.03 
 
 		 582 aa  327  5e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  35.46 
 
 		 636 aa  326  7e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  35.5 
 
 		 672 aa  325  9e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  34.64 
 
 		 641 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  36.35 
 
 		 650 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  36.36 
 
 		 634 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  35.47 
 
 		 643 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  35.61 
 
 		 622 aa  323  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2428  ABC transporter related  36.88 
 
 		 625 aa  323  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1348  ABC transporter related  37 
 
 		 625 aa  323  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03980  ABC transporter ATP-binding protein  36.02 
 
 		 650 aa  323  5e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  36.83 
 
 		 636 aa  322  7e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.52 
 
 		 639 aa  322  8e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.21 
 
 		 637 aa  322  9.999999999999999e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1376  ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 		 676 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636737  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 		 651 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  34.03 
 
 		 659 aa  322  9.999999999999999e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  33.27 
 
 		 637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  33.27 
 
 		 637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  33.27 
 
 		 637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>