More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89162 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  71.62 
 
 		 610 aa  903    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  100 
 
 		 609 aa  1246    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  54.9 
 
 		 625 aa  669    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  54.14 
 
 		 557 aa  610  1e-173  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16090  predicted protein  52.04 
 
 		 524 aa  542  1e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292057  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  48.5 
 
 		 521 aa  500  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41659  predicted protein  44.99 
 
 		 645 aa  493  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.666462  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  42.77 
 
 		 631 aa  403  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  41.9 
 
 		 623 aa  404  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  37.43 
 
 		 751 aa  382  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  36.98 
 
 		 732 aa  376  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89200  predicted protein  36.39 
 
 		 685 aa  374  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.564175 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68683  ATP-binding cassette (ABC) family, regulator of translational elongation  35.59 
 
 		 752 aa  369  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  38.1 
 
 		 527 aa  349  7e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.41 
 
 		 635 aa  340  5e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.41 
 
 		 635 aa  340  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.41 
 
 		 635 aa  340  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.41 
 
 		 635 aa  339  7e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.41 
 
 		 635 aa  339  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  37.03 
 
 		 637 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  37.03 
 
 		 637 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.62 
 
 		 640 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  37.03 
 
 		 637 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.62 
 
 		 640 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.6 
 
 		 637 aa  339  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.03 
 
 		 637 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.03 
 
 		 637 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.03 
 
 		 637 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.03 
 
 		 637 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.43 
 
 		 640 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.03 
 
 		 637 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  35.51 
 
 		 645 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.35 
 
 		 635 aa  336  7e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 		 635 aa  336  7.999999999999999e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  35.47 
 
 		 636 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.11 
 
 		 637 aa  332  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  35.34 
 
 		 615 aa  330  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.86 
 
 		 637 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.92 
 
 		 639 aa  326  9e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 		 634 aa  323  8e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0112  ABC transporter related  36.82 
 
 		 650 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.339786  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  34.91 
 
 		 629 aa  319  7.999999999999999e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0048  ABC transporter related  34.39 
 
 		 664 aa  319  9e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  37.9 
 
 		 533 aa  316  9e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  34.09 
 
 		 625 aa  316  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  34.72 
 
 		 624 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  34.54 
 
 		 627 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  35.66 
 
 		 639 aa  313  5.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1348  ABC transporter related  35.93 
 
 		 625 aa  312  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  34.46 
 
 		 625 aa  311  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.32 
 
 		 639 aa  311  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  35.66 
 
 		 659 aa  311  2.9999999999999997e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  33.27 
 
 		 627 aa  310  5e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  33.4 
 
 		 636 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  34.71 
 
 		 622 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  36.04 
 
 		 651 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  34.03 
 
 		 633 aa  307  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  34.16 
 
 		 627 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  33.15 
 
 		 642 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 		 532 aa  306  5.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  35.85 
 
 		 636 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  31.95 
 
 		 633 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 		 638 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  33.4 
 
 		 641 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  34.77 
 
 		 638 aa  304  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03980  ABC transporter ATP-binding protein  36.98 
 
 		 650 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  33.33 
 
 		 615 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  33.02 
 
 		 648 aa  303  8.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  33.58 
 
 		 532 aa  303  8.000000000000001e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2351  ABC transpoter ATPase  34.31 
 
 		 650 aa  302  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.683326 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  33.33 
 
 		 615 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 627 aa  301  2e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  34.95 
 
 		 635 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2338  ABC transporter related protein  35.54 
 
 		 635 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0045  ABC transporter related  33.4 
 
 		 663 aa  301  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.919141  normal  0.873152 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 640 aa  301  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  33.9 
 
 		 637 aa  301  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  32.83 
 
 		 625 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0037  ABC transporter ATPase  33.4 
 
 		 672 aa  300  4e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.489009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  34.97 
 
 		 633 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0433  ABC transporter, ATP-binding protein  35.34 
 
 		 641 aa  300  5e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  35.28 
 
 		 643 aa  300  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  34.15 
 
 		 615 aa  300  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1302  ABC transporter, ATP-binding protein  34.53 
 
 		 639 aa  298  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  33.83 
 
 		 657 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  36.04 
 
 		 672 aa  297  3e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0279  ABC transporter related  33.27 
 
 		 673 aa  297  5e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2962  ABC transporter related  32.65 
 
 		 619 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0574525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  32.29 
 
 		 625 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  34.97 
 
 		 636 aa  296  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  34.58 
 
 		 637 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  34.58 
 
 		 637 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  34.58 
 
 		 637 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0572  ABC transporter related  32.82 
 
 		 628 aa  295  1e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  33.96 
 
 		 643 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  35.14 
 
 		 636 aa  295  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  34.4 
 
 		 635 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2041  ABC transporter related  34.13 
 
 		 651 aa  295  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  35.27 
 
 		 645 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  34.26 
 
 		 636 aa  295  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>