More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41659 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_41659  predicted protein  100 
 
 		 645 aa  1345    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.666462  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  53.83 
 
 		 521 aa  607  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  46.85 
 
 		 610 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  43.99 
 
 		 609 aa  495  1e-139  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  45.11 
 
 		 557 aa  476  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  43.49 
 
 		 625 aa  475  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  43.35 
 
 		 631 aa  436  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16090  predicted protein  44.21 
 
 		 524 aa  429  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292057  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  40.7 
 
 		 623 aa  409  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89200  predicted protein  40 
 
 		 685 aa  401  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.564175 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  36.13 
 
 		 732 aa  391  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  36.84 
 
 		 751 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  38.26 
 
 		 527 aa  383  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68683  ATP-binding cassette (ABC) family, regulator of translational elongation  36.99 
 
 		 752 aa  366  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  37.27 
 
 		 645 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  35.39 
 
 		 615 aa  337  3.9999999999999995e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  36.33 
 
 		 533 aa  326  9e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  35.3 
 
 		 636 aa  325  2e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  34.77 
 
 		 633 aa  324  3e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  34.83 
 
 		 625 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  35.33 
 
 		 625 aa  324  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  34.37 
 
 		 642 aa  323  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  34.27 
 
 		 615 aa  320  6e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  34.27 
 
 		 615 aa  320  7e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.9 
 
 		 635 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  36.64 
 
 		 625 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  34.08 
 
 		 659 aa  317  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  33.46 
 
 		 629 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  35.33 
 
 		 625 aa  317  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2962  ABC transporter related  36.38 
 
 		 619 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0574525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 		 637 aa  317  4e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.71 
 
 		 635 aa  317  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.21 
 
 		 635 aa  317  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.21 
 
 		 635 aa  317  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  33.52 
 
 		 637 aa  316  7e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  33.52 
 
 		 637 aa  316  7e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  33.52 
 
 		 637 aa  316  7e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 		 637 aa  316  7e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 		 637 aa  316  7e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 		 637 aa  316  7e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 		 637 aa  316  7e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  34.83 
 
 		 637 aa  316  8e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 		 637 aa  316  9e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1348  ABC transporter related  35.27 
 
 		 625 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.71 
 
 		 635 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.04 
 
 		 635 aa  314  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  33.94 
 
 		 635 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 		 634 aa  313  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  34.12 
 
 		 656 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  33.9 
 
 		 639 aa  313  4.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  35.45 
 
 		 622 aa  313  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  34.46 
 
 		 636 aa  312  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 		 635 aa  312  1e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  33.58 
 
 		 627 aa  312  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  33.27 
 
 		 627 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  33.08 
 
 		 627 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2317  ABC transporter related  35.51 
 
 		 627 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  35.26 
 
 		 615 aa  310  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  34.27 
 
 		 627 aa  310  5.9999999999999995e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.71 
 
 		 640 aa  310  5.9999999999999995e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  35.21 
 
 		 635 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0238  ABC transporter related  37.41 
 
 		 625 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.773221  normal  0.692019 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 640 aa  308  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 640 aa  308  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  34.33 
 
 		 635 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  33.15 
 
 		 634 aa  306  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  33.77 
 
 		 642 aa  306  8.000000000000001e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  32.77 
 
 		 532 aa  306  9.000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 		 638 aa  306  9.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  34.08 
 
 		 657 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  32.05 
 
 		 636 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0433  ABC transporter, ATP-binding protein  34.64 
 
 		 641 aa  304  3.0000000000000004e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 		 638 aa  305  3.0000000000000004e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.08 
 
 		 639 aa  303  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  34.46 
 
 		 651 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  32.59 
 
 		 532 aa  303  9e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  33.9 
 
 		 618 aa  303  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.72 
 
 		 637 aa  302  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1302  ABC transporter, ATP-binding protein  35.18 
 
 		 639 aa  302  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.52 
 
 		 637 aa  301  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  33.4 
 
 		 640 aa  301  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  34.12 
 
 		 636 aa  301  3e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 		 627 aa  300  4e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  33.9 
 
 		 636 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  32.97 
 
 		 643 aa  300  6e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  34.27 
 
 		 637 aa  300  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  34.27 
 
 		 637 aa  300  8e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  33.39 
 
 		 630 aa  299  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3118  ABC transporter related  33.21 
 
 		 631 aa  299  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  34.08 
 
 		 637 aa  299  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  34.08 
 
 		 636 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  34.39 
 
 		 648 aa  298  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  33.03 
 
 		 636 aa  298  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  34.08 
 
 		 637 aa  296  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  33.77 
 
 		 636 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.93 
 
 		 639 aa  295  1e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1075  predicted protein  34.85 
 
 		 518 aa  296  1e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03980  ABC transporter ATP-binding protein  34.58 
 
 		 650 aa  295  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  33.77 
 
 		 633 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  33.9 
 
 		 672 aa  295  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>