More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_16090 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_16090  predicted protein  100 
 
 
524 aa  1088    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292057  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  62.96 
 
 
557 aa  706    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  52.04 
 
 
609 aa  564  1.0000000000000001e-159  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  52.4 
 
 
610 aa  556  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  47.54 
 
 
625 aa  503  1e-141  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  49.62 
 
 
521 aa  498  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41659  predicted protein  43.84 
 
 
645 aa  451  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.666462  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  38.56 
 
 
751 aa  391  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  41.76 
 
 
631 aa  391  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68683  ATP-binding cassette (ABC) family, regulator of translational elongation  39.66 
 
 
752 aa  385  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525981  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  39.77 
 
 
623 aa  374  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89200  predicted protein  37.44 
 
 
685 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.564175 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  37.36 
 
 
732 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  35.93 
 
 
527 aa  328  2.0000000000000001e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  35.37 
 
 
615 aa  322  9.000000000000001e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.84 
 
 
635 aa  316  6e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  35.37 
 
 
615 aa  316  8e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  35.37 
 
 
615 aa  315  9e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.84 
 
 
635 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.84 
 
 
635 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.84 
 
 
635 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.84 
 
 
635 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  35.82 
 
 
659 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  35.82 
 
 
639 aa  314  2.9999999999999996e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.68 
 
 
637 aa  313  5.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.68 
 
 
637 aa  313  6.999999999999999e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.68 
 
 
637 aa  312  9e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  34.68 
 
 
637 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  34.68 
 
 
637 aa  312  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.68 
 
 
637 aa  312  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.68 
 
 
637 aa  312  1e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 
635 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  34.68 
 
 
637 aa  312  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.68 
 
 
637 aa  312  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  35.04 
 
 
625 aa  311  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.68 
 
 
635 aa  311  2e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3835  ABC transporter ATP-binding protein  34.86 
 
 
622 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.551802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  34.55 
 
 
636 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  34.8 
 
 
642 aa  310  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  35.74 
 
 
615 aa  310  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2962  ABC transporter related  34.86 
 
 
619 aa  309  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0574525  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  34.86 
 
 
625 aa  309  9e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 
637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  34.61 
 
 
641 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  34.03 
 
 
633 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0048  ABC transporter related  34.02 
 
 
664 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  34.23 
 
 
633 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.45 
 
 
640 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.45 
 
 
640 aa  307  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  34.72 
 
 
532 aa  307  4.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  37.82 
 
 
533 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
624 aa  306  6e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  33.85 
 
 
627 aa  306  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2317  ABC transporter related  34.67 
 
 
627 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.359814  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 
638 aa  306  8.000000000000001e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  34.48 
 
 
635 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  36.73 
 
 
640 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.07 
 
 
640 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  34.72 
 
 
532 aa  305  1.0000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  34.28 
 
 
625 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 
634 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3467  ABC transporter related  34.86 
 
 
625 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 
639 aa  302  8.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  33.91 
 
 
645 aa  302  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  33.85 
 
 
627 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  33.85 
 
 
629 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.07 
 
 
637 aa  299  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  36.4 
 
 
692 aa  299  9e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  36.14 
 
 
635 aa  299  9e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  36.73 
 
 
643 aa  299  9e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 
651 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  35.51 
 
 
636 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  36.47 
 
 
645 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  33.84 
 
 
636 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  35.44 
 
 
627 aa  297  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  36.33 
 
 
672 aa  297  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  36.08 
 
 
638 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  35.32 
 
 
636 aa  296  8e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1376  ABC transporter ATP-binding protein  36.99 
 
 
676 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636737  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0045  ABC transporter related  32.39 
 
 
663 aa  295  1e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.919141  normal  0.873152 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0112  ABC transporter related  36.93 
 
 
650 aa  295  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.339786  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  34.56 
 
 
646 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0037  ABC transporter ATPase  32.39 
 
 
672 aa  295  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.489009  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.3 
 
 
634 aa  295  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  35.7 
 
 
633 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  36.14 
 
 
636 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1302  ABC transporter, ATP-binding protein  34.8 
 
 
639 aa  293  6e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  36.14 
 
 
636 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  35.89 
 
 
636 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0220  ABC transporter related  36.7 
 
 
615 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.04 
 
 
639 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  35.44 
 
 
642 aa  291  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  34.67 
 
 
650 aa  291  2e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 
657 aa  290  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  34.54 
 
 
618 aa  290  4e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  34.02 
 
 
630 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1992  ABC transporter related  34.89 
 
 
678 aa  290  6e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  34.59 
 
 
648 aa  289  7e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  35.32 
 
 
636 aa  289  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  35 
 
 
643 aa  288  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>