More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_89200 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_89200  predicted protein  100 
 
 
685 aa  1411    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.564175 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  45.33 
 
 
623 aa  481  1e-134  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  40.12 
 
 
751 aa  445  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  40.1 
 
 
521 aa  420  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  39.16 
 
 
732 aa  421  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41659  predicted protein  39.83 
 
 
645 aa  419  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.666462  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  39.46 
 
 
557 aa  413  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68683  ATP-binding cassette (ABC) family, regulator of translational elongation  38.94 
 
 
752 aa  410  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525981  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  39.73 
 
 
631 aa  400  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  36.7 
 
 
609 aa  389  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  37.69 
 
 
625 aa  375  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  34.76 
 
 
610 aa  371  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  37 
 
 
527 aa  372  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16090  predicted protein  37.48 
 
 
524 aa  360  7e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292057  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  37.35 
 
 
615 aa  350  5e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  37.07 
 
 
645 aa  340  7e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  38.33 
 
 
618 aa  339  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  37.44 
 
 
615 aa  333  8e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  37.09 
 
 
642 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  37.44 
 
 
615 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3197  ABC transporter ATP-binding protein  36.03 
 
 
638 aa  328  2.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.79023  normal  0.0446478 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  35.73 
 
 
633 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14998  predicted protein  33.82 
 
 
582 aa  327  4.0000000000000003e-88  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  37.7 
 
 
533 aa  325  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 
640 aa  324  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 
640 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.56 
 
 
640 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  35.92 
 
 
635 aa  320  6e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.45 
 
 
635 aa  318  2e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.66 
 
 
637 aa  317  3e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  35.56 
 
 
636 aa  318  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  36.52 
 
 
624 aa  317  5e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  35.17 
 
 
636 aa  314  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  35.45 
 
 
637 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  35.96 
 
 
636 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.25 
 
 
635 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  35.45 
 
 
637 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  35.45 
 
 
637 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  33.62 
 
 
636 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  35.27 
 
 
637 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  34.36 
 
 
629 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 
637 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  34.83 
 
 
637 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  34.83 
 
 
637 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 
638 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00070  ABC transporter, ATP-binding subunit  33.74 
 
 
639 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  34.66 
 
 
637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  33.8 
 
 
656 aa  307  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  35.41 
 
 
615 aa  308  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  34.26 
 
 
627 aa  308  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  34.28 
 
 
657 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.04 
 
 
637 aa  306  8.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  34.04 
 
 
637 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  34.04 
 
 
637 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.04 
 
 
637 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.04 
 
 
637 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  34.04 
 
 
637 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.04 
 
 
637 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.04 
 
 
637 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  33.74 
 
 
659 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.04 
 
 
637 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  34.5 
 
 
627 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.86 
 
 
637 aa  305  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  34.13 
 
 
635 aa  305  3.0000000000000004e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  34.68 
 
 
650 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  34.37 
 
 
627 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0433  ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 
641 aa  302  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  35.22 
 
 
637 aa  302  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  32.77 
 
 
657 aa  302  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.96 
 
 
639 aa  302  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.63 
 
 
634 aa  301  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 
634 aa  302  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.22 
 
 
635 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.22 
 
 
635 aa  301  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.22 
 
 
635 aa  301  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.22 
 
 
635 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  33.39 
 
 
630 aa  300  4e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  33.11 
 
 
650 aa  301  4e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  33.63 
 
 
639 aa  299  9e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  33.39 
 
 
643 aa  299  1e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0298  ABC transporter ATP-binding protein  34.14 
 
 
643 aa  299  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  34.04 
 
 
635 aa  299  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0572  ABC transporter related  33.56 
 
 
628 aa  299  1e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  34.69 
 
 
636 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3856  ABC transporter related  32.94 
 
 
559 aa  298  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 
640 aa  297  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  33.73 
 
 
627 aa  297  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  32.37 
 
 
646 aa  296  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  34.14 
 
 
633 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  33.28 
 
 
636 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  32.12 
 
 
532 aa  294  4e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  34.48 
 
 
636 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  34.48 
 
 
636 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1759  ABC transporter-related protein  33.28 
 
 
554 aa  293  9e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.656937  normal  0.0503302 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  33.28 
 
 
625 aa  292  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1302  ABC transporter, ATP-binding protein  33.51 
 
 
639 aa  292  2e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2715  ABC transporter related  32.93 
 
 
650 aa  291  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  34.83 
 
 
636 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  32.54 
 
 
625 aa  290  6e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
651 aa  290  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>