More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_88728 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06651  mRNA-nucleus export ATPase (Elf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03580)  48.05 
 
 		 1118 aa  989    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88728  predicted protein  100 
 
 		 1141 aa  2352    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal  0.12515 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00950  mRNA export factor elf1, putative  43.16 
 
 		 1100 aa  843    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.484404  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45865  predicted protein  40.95 
 
 		 923 aa  650    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.80899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89073  predicted protein  40.21 
 
 		 1031 aa  640    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161283  normal  0.722598 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90176  translation elongation factor  39.76 
 
 		 1048 aa  647    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.902447  normal  0.536047 
 
 
-
 
NC_006686  CND02420  elongation factor 3  38.19 
 
 		 1055 aa  612  1e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.103235  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27838  predicted protein  37.89 
 
 		 1040 aa  560  1e-158  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06700  elongation factor 3 (Eurofung)  36.28 
 
 		 917 aa  556  1e-157  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.617822 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36160  predicted protein  31.81 
 
 		 995 aa  444  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9372  predicted protein  44.89 
 
 		 504 aa  421  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35279  predicted protein  38.1 
 
 		 528 aa  367  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  30.72 
 
 		 732 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  32.28 
 
 		 533 aa  191  7e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  32.65 
 
 		 527 aa  190  1e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  32.11 
 
 		 751 aa  187  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  31.92 
 
 		 651 aa  182  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  30.18 
 
 		 521 aa  180  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  30.03 
 
 		 557 aa  174  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  32.3 
 
 		 624 aa  174  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  31.63 
 
 		 636 aa  173  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  30.96 
 
 		 631 aa  172  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  31.25 
 
 		 623 aa  171  9e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  28.74 
 
 		 625 aa  169  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3138  ABC transporter related  30.45 
 
 		 621 aa  170  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00577211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  31.19 
 
 		 636 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2600  ABC transporter, ATP-binding protein  31.04 
 
 		 646 aa  168  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0562857  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.92 
 
 		 637 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  27.57 
 
 		 609 aa  167  6.9999999999999995e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  28.73 
 
 		 637 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  28.73 
 
 		 637 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1572  ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 		 646 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.50284  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2455  ABC transporter, ATP-binding protein  31.04 
 
 		 646 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242369  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.73 
 
 		 637 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.73 
 
 		 637 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3237  ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 		 646 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2075  ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 		 646 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.491633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.73 
 
 		 637 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2511  ABC transporter, ATP-binding protein  31.04 
 
 		 646 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.271255  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.73 
 
 		 637 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  28.73 
 
 		 637 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.73 
 
 		 637 aa  167  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1347  ABC transporter, ATP-binding protein  31.3 
 
 		 646 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  31.53 
 
 		 657 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  32.22 
 
 		 636 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  31.14 
 
 		 638 aa  166  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  30.72 
 
 		 657 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  31.06 
 
 		 645 aa  165  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  32.26 
 
 		 635 aa  165  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  29.79 
 
 		 636 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  31.13 
 
 		 635 aa  164  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  30.81 
 
 		 692 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  31.35 
 
 		 646 aa  163  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0220  ABC transporter related  29.95 
 
 		 615 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.19 
 
 		 637 aa  163  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  31.44 
 
 		 637 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  31.44 
 
 		 637 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  31.44 
 
 		 637 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  29.05 
 
 		 636 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1376  ABC transporter ATP-binding protein  30.71 
 
 		 676 aa  162  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636737  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1830  hypothetical protein  30.41 
 
 		 616 aa  162  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  29.05 
 
 		 636 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  28.02 
 
 		 610 aa  162  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.04 
 
 		 640 aa  162  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  30.1 
 
 		 672 aa  162  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.04 
 
 		 640 aa  162  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.04 
 
 		 640 aa  162  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  31.27 
 
 		 656 aa  162  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.59 
 
 		 635 aa  161  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2010  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 		 646 aa  161  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  30.95 
 
 		 636 aa  162  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  29.85 
 
 		 627 aa  161  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  29.95 
 
 		 627 aa  161  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  30.95 
 
 		 637 aa  161  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  30.95 
 
 		 637 aa  161  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  30.95 
 
 		 637 aa  161  8e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3136  ABC transporter related  31.03 
 
 		 644 aa  161  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.59 
 
 		 635 aa  161  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14998  predicted protein  28.05 
 
 		 582 aa  160  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  31.58 
 
 		 654 aa  160  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  29.79 
 
 		 636 aa  160  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 637 aa  160  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  30.03 
 
 		 643 aa  160  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.34 
 
 		 639 aa  160  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  29.88 
 
 		 645 aa  160  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  30.85 
 
 		 638 aa  159  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1833  hypothetical protein  30.41 
 
 		 616 aa  159  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  30.41 
 
 		 641 aa  159  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  31.54 
 
 		 636 aa  159  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.86 
 
 		 635 aa  159  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.86 
 
 		 635 aa  159  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.86 
 
 		 635 aa  159  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2480  ABC transporter-related protein  29.95 
 
 		 676 aa  159  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  30.55 
 
 		 633 aa  159  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  30.85 
 
 		 637 aa  159  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.64 
 
 		 634 aa  158  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.86 
 
 		 635 aa  158  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.41 
 
 		 635 aa  157  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  27.54 
 
 		 532 aa  157  8e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  28.5 
 
 		 639 aa  157  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>