More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_90176 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06700  elongation factor 3 (Eurofung)  63.23 
 
 		 917 aa  1159    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.617822 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90176  translation elongation factor  100 
 
 		 1048 aa  2168    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.902447  normal  0.536047 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00950  mRNA export factor elf1, putative  40.26 
 
 		 1100 aa  656    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.484404  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02420  elongation factor 3  46.43 
 
 		 1055 aa  885    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.103235  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27838  predicted protein  41.57 
 
 		 1040 aa  702    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89073  predicted protein  46.26 
 
 		 1031 aa  790    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161283  normal  0.722598 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88728  predicted protein  38.9 
 
 		 1141 aa  654    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal  0.12515 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06651  mRNA-nucleus export ATPase (Elf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03580)  40.22 
 
 		 1118 aa  632  1e-180  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45865  predicted protein  39.82 
 
 		 923 aa  632  1e-180  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.80899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36160  predicted protein  32.49 
 
 		 995 aa  465  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9372  predicted protein  43.31 
 
 		 504 aa  405  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35279  predicted protein  39.32 
 
 		 528 aa  363  6e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  31.19 
 
 		 527 aa  181  7e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  31.22 
 
 		 623 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  29.14 
 
 		 521 aa  174  6.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  30.4 
 
 		 533 aa  174  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  26.24 
 
 		 636 aa  165  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  27.13 
 
 		 636 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  28.64 
 
 		 625 aa  163  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  25.78 
 
 		 637 aa  162  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  36.26 
 
 		 732 aa  161  5e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  25.78 
 
 		 637 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  25.78 
 
 		 637 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  25.78 
 
 		 637 aa  160  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  25.94 
 
 		 636 aa  158  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  29.07 
 
 		 654 aa  157  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  29.27 
 
 		 641 aa  157  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  29.82 
 
 		 657 aa  156  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  27.79 
 
 		 557 aa  156  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  25.81 
 
 		 637 aa  156  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  25.81 
 
 		 637 aa  156  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  26.35 
 
 		 657 aa  156  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  25.81 
 
 		 637 aa  156  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3178  ABC transporter related  25.75 
 
 		 650 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  26.62 
 
 		 656 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  29.51 
 
 		 751 aa  155  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1347  ABC transporter, ATP-binding protein  29.95 
 
 		 646 aa  155  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1572  ABC transporter, ATP-binding protein  29.95 
 
 		 646 aa  155  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.50284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3237  ABC transporter, ATP-binding protein  29.95 
 
 		 646 aa  155  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2075  ABC transporter, ATP-binding protein  29.95 
 
 		 646 aa  155  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.491633  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  28.19 
 
 		 609 aa  154  7e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  28.42 
 
 		 643 aa  153  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2600  ABC transporter, ATP-binding protein  29.43 
 
 		 646 aa  153  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0562857  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41659  predicted protein  27.68 
 
 		 645 aa  153  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.666462  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  25.85 
 
 		 636 aa  153  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2511  ABC transporter, ATP-binding protein  29.43 
 
 		 646 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.271255  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2455  ABC transporter, ATP-binding protein  29.43 
 
 		 646 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242369  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  29.38 
 
 		 646 aa  151  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  27 
 
 		 645 aa  151  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  28.75 
 
 		 624 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2010  ABC transporter, ATP-binding protein  29.43 
 
 		 646 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  25.7 
 
 		 637 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  28.23 
 
 		 633 aa  148  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  27.27 
 
 		 672 aa  149  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  28.82 
 
 		 650 aa  148  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  26.79 
 
 		 648 aa  148  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6041  ABC transporter related  28.17 
 
 		 643 aa  148  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2036  ABC transporter related  28.17 
 
 		 643 aa  148  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252943  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2055  ABC transporter related  28.17 
 
 		 643 aa  148  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.035925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  26.93 
 
 		 692 aa  147  8.000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  29.09 
 
 		 651 aa  147  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  29.09 
 
 		 636 aa  147  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  28.61 
 
 		 636 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1376  ABC transporter ATP-binding protein  28.07 
 
 		 676 aa  146  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  28.85 
 
 		 636 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5345  ABC transporter, fused ATPase subunits  27.91 
 
 		 643 aa  146  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  26.75 
 
 		 642 aa  146  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1830  hypothetical protein  29.75 
 
 		 616 aa  146  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2068  ABC transporter related  27.72 
 
 		 643 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  28.61 
 
 		 636 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1833  hypothetical protein  29.5 
 
 		 616 aa  144  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  28.13 
 
 		 636 aa  144  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  28.74 
 
 		 638 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2071  ABC transporter related  27.41 
 
 		 656 aa  144  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.144058 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1894  ABC transporter related  27.41 
 
 		 656 aa  144  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  26.2 
 
 		 627 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3690  ABC transporter, ATPase subunit  28.21 
 
 		 599 aa  143  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  29.58 
 
 		 636 aa  142  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3136  ABC transporter related  28.29 
 
 		 644 aa  142  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.81 
 
 		 637 aa  142  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  25.95 
 
 		 627 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  30.16 
 
 		 631 aa  141  4.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68683  ATP-binding cassette (ABC) family, regulator of translational elongation  27.91 
 
 		 752 aa  141  6e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  28.5 
 
 		 638 aa  141  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  28.35 
 
 		 637 aa  141  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  28.35 
 
 		 637 aa  141  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  28.35 
 
 		 637 aa  141  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.35 
 
 		 637 aa  141  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.11 
 
 		 637 aa  141  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.82 
 
 		 640 aa  141  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.35 
 
 		 637 aa  141  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.82 
 
 		 640 aa  141  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.35 
 
 		 637 aa  141  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.82 
 
 		 640 aa  141  7e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.11 
 
 		 637 aa  141  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0279  ABC transporter related  27.74 
 
 		 673 aa  140  8.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  26.03 
 
 		 610 aa  140  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0048  ABC transporter related  25.06 
 
 		 664 aa  140  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  29.95 
 
 		 631 aa  140  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2338  ABC transporter related protein  27.3 
 
 		 635 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>