More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_36160 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_36160  predicted protein  100 
 
 
995 aa  2053    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35279  predicted protein  51.24 
 
 
528 aa  554  1e-156  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_006686  CND02420  elongation factor 3  33.43 
 
 
1055 aa  515  1e-144  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.103235  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90176  translation elongation factor  32.5 
 
 
1048 aa  462  9.999999999999999e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.902447  normal  0.536047 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06651  mRNA-nucleus export ATPase (Elf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03580)  32.52 
 
 
1118 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88728  predicted protein  31.04 
 
 
1141 aa  447  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal  0.12515 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27838  predicted protein  34.3 
 
 
1040 aa  443  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45865  predicted protein  32.28 
 
 
923 aa  432  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.80899  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00950  mRNA export factor elf1, putative  31.04 
 
 
1100 aa  429  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.484404  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06700  elongation factor 3 (Eurofung)  33.42 
 
 
917 aa  413  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.617822 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89073  predicted protein  37.7 
 
 
1031 aa  386  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161283  normal  0.722598 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9372  predicted protein  37.62 
 
 
504 aa  364  4e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_81  predicted protein  40.48 
 
 
1330 aa  234  8.000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.267422 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84618  GCN1; translational activator of GCN4  32.93 
 
 
2721 aa  178  6e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  31.19 
 
 
521 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49748  predicted protein  30.8 
 
 
2821 aa  171  8e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02430  regulation of translational elongation-related protein, putative  31.83 
 
 
2611 aa  170  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  29.6 
 
 
751 aa  168  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  28.3 
 
 
609 aa  166  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  28.88 
 
 
732 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10734  translational activator, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07960)  32.53 
 
 
2672 aa  163  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257702 
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  28.67 
 
 
625 aa  163  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  28.43 
 
 
533 aa  162  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  28.01 
 
 
623 aa  157  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  27.56 
 
 
627 aa  154  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68683  ATP-binding cassette (ABC) family, regulator of translational elongation  28.74 
 
 
752 aa  153  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525981  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  30.05 
 
 
610 aa  152  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  27.73 
 
 
624 aa  152  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  28.33 
 
 
557 aa  152  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.04 
 
 
635 aa  152  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  27.56 
 
 
637 aa  151  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 
640 aa  152  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  28.95 
 
 
654 aa  151  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 
640 aa  151  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 
640 aa  152  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.28 
 
 
637 aa  151  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.04 
 
 
635 aa  151  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  28.25 
 
 
627 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.27 
 
 
639 aa  150  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 
637 aa  149  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  27.53 
 
 
627 aa  148  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 
637 aa  148  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 
637 aa  148  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  28.54 
 
 
637 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  28.54 
 
 
637 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 
637 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 
637 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  28.54 
 
 
637 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 
637 aa  147  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.89 
 
 
639 aa  147  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 
637 aa  147  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  28.74 
 
 
527 aa  146  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  29.06 
 
 
651 aa  146  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.97 
 
 
635 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41659  predicted protein  26.59 
 
 
645 aa  146  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.666462  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  27.27 
 
 
640 aa  145  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  29.23 
 
 
633 aa  145  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.72 
 
 
635 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  29.31 
 
 
636 aa  144  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.72 
 
 
635 aa  144  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.72 
 
 
635 aa  144  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  28.35 
 
 
627 aa  144  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  29.88 
 
 
631 aa  144  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  26.17 
 
 
629 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  27.6 
 
 
615 aa  142  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  27.88 
 
 
615 aa  142  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.46 
 
 
635 aa  142  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2186  ABC transporter, ATP-binding protein  27.9 
 
 
638 aa  142  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151795  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  27.56 
 
 
615 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  27.34 
 
 
633 aa  141  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  27.88 
 
 
638 aa  141  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.46 
 
 
634 aa  140  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  26.09 
 
 
642 aa  140  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  27.64 
 
 
638 aa  140  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  27.91 
 
 
636 aa  140  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3138  ABC transporter related  27.63 
 
 
621 aa  140  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00577211  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0045  ABC transporter related  25.22 
 
 
663 aa  140  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.919141  normal  0.873152 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  26.15 
 
 
672 aa  139  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  27.8 
 
 
627 aa  139  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0037  ABC transporter ATPase  25.22 
 
 
672 aa  139  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.489009  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  26.14 
 
 
642 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  28.75 
 
 
636 aa  138  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  26.38 
 
 
625 aa  138  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  27.18 
 
 
636 aa  137  8e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0878  ABC transporter related  24.76 
 
 
694 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.0940441 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  28.5 
 
 
636 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1830  hypothetical protein  27.71 
 
 
616 aa  136  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  28.5 
 
 
636 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16090  predicted protein  29.23 
 
 
524 aa  135  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00292057  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14998  predicted protein  30.93 
 
 
582 aa  135  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  28.71 
 
 
645 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  27.97 
 
 
618 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002284  glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein  27.29 
 
 
659 aa  134  6.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.43126  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1833  hypothetical protein  27.71 
 
 
616 aa  134  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  27.23 
 
 
615 aa  134  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0876  ABC transporter-related protein  24.72 
 
 
673 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  28.71 
 
 
672 aa  133  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  26.86 
 
 
635 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  26.42 
 
 
532 aa  133  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  26.42 
 
 
532 aa  132  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>