20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB02430 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_10734  translational activator, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07960)  38.52 
 
 
2672 aa  1416    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257702 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49748  predicted protein  36.57 
 
 
2821 aa  655    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02430  regulation of translational elongation-related protein, putative  100 
 
 
2611 aa  5302    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_81  predicted protein  40.12 
 
 
1330 aa  796    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.267422 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84618  GCN1; translational activator of GCN4  36.28 
 
 
2721 aa  1343    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36160  predicted protein  31.83 
 
 
995 aa  170  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02420  elongation factor 3  30.99 
 
 
1055 aa  125  9e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.103235  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90176  translation elongation factor  30.86 
 
 
1048 aa  122  7.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.902447  normal  0.536047 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44942  predicted protein  30.57 
 
 
556 aa  114  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45865  predicted protein  33.82 
 
 
923 aa  107  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.80899  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00950  mRNA export factor elf1, putative  27.46 
 
 
1100 aa  95.1  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.484404  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27838  predicted protein  30.34 
 
 
1040 aa  93.6  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  24.76 
 
 
1328 aa  86.3  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89073  predicted protein  27.84 
 
 
1031 aa  84.3  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161283  normal  0.722598 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88728  predicted protein  25.52 
 
 
1141 aa  78.6  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal  0.12515 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06651  mRNA-nucleus export ATPase (Elf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03580)  23.92 
 
 
1118 aa  57  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06700  elongation factor 3 (Eurofung)  32.59 
 
 
917 aa  55.5  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.617822 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  23.22 
 
 
838 aa  53.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00926  KapC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2LD07]  21.95 
 
 
939 aa  51.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.335104  normal  0.533348 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01010  importin beta-2 subunit, putative  24.04 
 
 
924 aa  46.2  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>