More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_27838 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06700  elongation factor 3 (Eurofung)  40.68 
 
 		 917 aa  653    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.617822 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89073  predicted protein  45.53 
 
 		 1031 aa  775    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161283  normal  0.722598 
 
 
-
 
NC_006686  CND02420  elongation factor 3  43.42 
 
 		 1055 aa  738    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.103235  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27838  predicted protein  100 
 
 		 1040 aa  2144    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90176  translation elongation factor  41.63 
 
 		 1048 aa  733    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.902447  normal  0.536047 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45865  predicted protein  51.14 
 
 		 923 aa  855    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.80899  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06651  mRNA-nucleus export ATPase (Elf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03580)  40 
 
 		 1118 aa  634  1e-180  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00950  mRNA export factor elf1, putative  37.24 
 
 		 1100 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.484404  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88728  predicted protein  36.88 
 
 		 1141 aa  597  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal  0.12515 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36160  predicted protein  34.37 
 
 		 995 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35279  predicted protein  41.19 
 
 		 528 aa  390  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9372  predicted protein  40.71 
 
 		 504 aa  387  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  28.23 
 
 		 521 aa  177  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  29.34 
 
 		 533 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  29.3 
 
 		 623 aa  167  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  27.19 
 
 		 609 aa  166  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  28.91 
 
 		 557 aa  165  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  29.43 
 
 		 527 aa  164  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  27.8 
 
 		 732 aa  162  2e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  28.18 
 
 		 625 aa  160  9e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  29.02 
 
 		 751 aa  160  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  26.85 
 
 		 540 aa  154  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1409  ABC transporter related  28.54 
 
 		 530 aa  153  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  28.34 
 
 		 528 aa  152  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  27.71 
 
 		 640 aa  151  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  29.1 
 
 		 528 aa  151  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  27.44 
 
 		 528 aa  150  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  29.35 
 
 		 528 aa  150  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  26.81 
 
 		 627 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  29.1 
 
 		 528 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28710  ABC transporter, ATP binding component  28.44 
 
 		 521 aa  150  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  29.1 
 
 		 528 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  27.47 
 
 		 627 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  26.17 
 
 		 672 aa  149  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  29.15 
 
 		 631 aa  149  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2535  ABC transporter related  27.63 
 
 		 530 aa  149  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.776559  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  27.49 
 
 		 629 aa  148  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  26.68 
 
 		 627 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1830  hypothetical protein  28.64 
 
 		 616 aa  147  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  29.55 
 
 		 624 aa  147  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  27.36 
 
 		 635 aa  147  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0572  ABC transporter related  28.81 
 
 		 628 aa  146  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0472  ABC transporter related  27.94 
 
 		 541 aa  146  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  26.39 
 
 		 627 aa  146  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3332  ABC transporter ATP-binding protein  28.54 
 
 		 529 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  27.25 
 
 		 543 aa  145  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  28.22 
 
 		 610 aa  145  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  28.04 
 
 		 642 aa  145  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.56 
 
 		 637 aa  145  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  28.32 
 
 		 672 aa  145  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39130  putative ATP-binding component of ABC transporter  29 
 
 		 521 aa  145  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  26.82 
 
 		 530 aa  144  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  26.82 
 
 		 530 aa  144  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  26.82 
 
 		 530 aa  144  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00804  hypothetical protein  26.82 
 
 		 530 aa  144  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0969  ABC transporter, ATP-binding protein  26.82 
 
 		 530 aa  144  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.12537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.56 
 
 		 637 aa  144  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  26.82 
 
 		 530 aa  144  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  26.82 
 
 		 530 aa  144  6e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0877  ABC transporter, ATP-binding protein  26.82 
 
 		 530 aa  144  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  27.56 
 
 		 637 aa  144  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  27.56 
 
 		 637 aa  144  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  27.56 
 
 		 637 aa  144  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.56 
 
 		 637 aa  144  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.56 
 
 		 637 aa  144  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.56 
 
 		 637 aa  144  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1623  hypothetical protein  29.64 
 
 		 636 aa  144  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  26.82 
 
 		 530 aa  144  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.29 
 
 		 635 aa  144  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.12 
 
 		 635 aa  144  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.29 
 
 		 635 aa  144  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.29 
 
 		 635 aa  144  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1676  ABC transporter-related protein  27.21 
 
 		 531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.762171  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  28.35 
 
 		 651 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1833  hypothetical protein  27.99 
 
 		 616 aa  143  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  28.91 
 
 		 645 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  26.08 
 
 		 531 aa  143  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1386  ABC transporter, ATP-binding protein  28.04 
 
 		 531 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.65535  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2753  ABC transporter related  26.71 
 
 		 530 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  27.31 
 
 		 529 aa  142  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.32 
 
 		 637 aa  142  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  28.75 
 
 		 654 aa  142  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_14998  predicted protein  30.69 
 
 		 582 aa  142  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.25 
 
 		 635 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1712  ABC transporter related  27.17 
 
 		 520 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1349  ABC transporter related  28.34 
 
 		 522 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3334  ABC transporter related  28.32 
 
 		 637 aa  141  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.05 
 
 		 635 aa  141  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0238  ABC transporter related  27.89 
 
 		 625 aa  141  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.773221  normal  0.692019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1606  ABC transporter related  26.3 
 
 		 528 aa  141  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  24.83 
 
 		 639 aa  141  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  25.85 
 
 		 531 aa  141  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  28.35 
 
 		 636 aa  141  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  26.87 
 
 		 528 aa  141  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1409  ABC transporter related  27.88 
 
 		 546 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0180506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2173  ABC transporter related  27.52 
 
 		 520 aa  140  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453186  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0936  ABC transporter ATP-binding protein  26.82 
 
 		 530 aa  140  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3190  ABC transporter related  27.29 
 
 		 531 aa  140  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1943  ABC transporter, fused ATPase subunits  28.03 
 
 		 530 aa  139  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  29.36 
 
 		 637 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>