More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_45865 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND02420  elongation factor 3  41.4 
 
 		 1055 aa  687    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.103235  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89073  predicted protein  45.61 
 
 		 1031 aa  744    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161283  normal  0.722598 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88728  predicted protein  41.11 
 
 		 1141 aa  665    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal  0.12515 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45865  predicted protein  100 
 
 		 923 aa  1914    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.80899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27838  predicted protein  51.48 
 
 		 1040 aa  827    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90176  translation elongation factor  39.7 
 
 		 1048 aa  644    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.902447  normal  0.536047 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00950  mRNA export factor elf1, putative  40.24 
 
 		 1100 aa  632  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.484404  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06651  mRNA-nucleus export ATPase (Elf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03580)  40.39 
 
 		 1118 aa  628  1e-178  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06700  elongation factor 3 (Eurofung)  39.68 
 
 		 917 aa  565  1.0000000000000001e-159  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.617822 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36160  predicted protein  32.33 
 
 		 995 aa  444  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9372  predicted protein  39.74 
 
 		 504 aa  381  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35279  predicted protein  37.29 
 
 		 528 aa  356  1e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  27.45 
 
 		 533 aa  162  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  28.03 
 
 		 625 aa  162  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  28.43 
 
 		 732 aa  160  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0936  ABC transporter ATP-binding protein  28.08 
 
 		 530 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0969  ABC transporter ATP-binding protein  27.86 
 
 		 531 aa  158  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0878  ABC transporter, ATP-binding protein  27.86 
 
 		 530 aa  158  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.720445  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0906  ABC transporter ATP-binding protein  27.86 
 
 		 530 aa  158  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.753314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0990  ABC transporter ATP-binding protein  27.86 
 
 		 531 aa  158  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166125  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  27.43 
 
 		 530 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00804  hypothetical protein  27.43 
 
 		 530 aa  156  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  27.43 
 
 		 530 aa  156  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 		 530 aa  156  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0877  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 		 530 aa  156  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 		 530 aa  156  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0969  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 		 530 aa  156  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.12537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  27.43 
 
 		 530 aa  156  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  27.43 
 
 		 530 aa  156  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  29.2 
 
 		 609 aa  154  7e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  27.65 
 
 		 651 aa  153  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  29.21 
 
 		 521 aa  152  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  25.93 
 
 		 623 aa  151  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  27.63 
 
 		 633 aa  149  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  27.96 
 
 		 642 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1311  ABC transporter related  26.78 
 
 		 531 aa  149  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  26.79 
 
 		 540 aa  149  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  27.21 
 
 		 636 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  29.21 
 
 		 636 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5997  ABC transporter ATP-binding protein  26.54 
 
 		 638 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  29.21 
 
 		 637 aa  147  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  29.21 
 
 		 637 aa  147  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  29.21 
 
 		 637 aa  147  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  26.36 
 
 		 636 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  26.36 
 
 		 636 aa  146  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  29.28 
 
 		 656 aa  146  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1409  ABC transporter related  26.98 
 
 		 530 aa  145  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0886  ABC transporter related  28.96 
 
 		 637 aa  145  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  27.76 
 
 		 751 aa  144  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2010  ABC transporter, ATP-binding protein  28.46 
 
 		 646 aa  144  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  28.29 
 
 		 643 aa  144  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.79 
 
 		 640 aa  144  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.79 
 
 		 640 aa  144  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.79 
 
 		 640 aa  144  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  26.98 
 
 		 645 aa  144  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  25.27 
 
 		 531 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1830  hypothetical protein  27.91 
 
 		 616 aa  144  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  26.43 
 
 		 636 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2999  ABC transporter ATP-binding protein  25.16 
 
 		 587 aa  143  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000839463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  29.85 
 
 		 657 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2055  ABC transporter related  27.79 
 
 		 643 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.035925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  27.41 
 
 		 527 aa  144  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6041  ABC transporter related  27.79 
 
 		 643 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  26.21 
 
 		 636 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2036  ABC transporter related  27.79 
 
 		 643 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252943  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  29.34 
 
 		 657 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1572  ABC transporter, ATP-binding protein  27.96 
 
 		 646 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.50284  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.89 
 
 		 635 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  29.1 
 
 		 650 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1347  ABC transporter, ATP-binding protein  27.96 
 
 		 646 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2600  ABC transporter, ATP-binding protein  27.96 
 
 		 646 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0562857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5345  ABC transporter, fused ATPase subunits  28.54 
 
 		 643 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2075  ABC transporter, ATP-binding protein  27.96 
 
 		 646 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.491633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3237  ABC transporter, ATP-binding protein  27.96 
 
 		 646 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  30.6 
 
 		 636 aa  142  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2535  ABC transporter related  26.95 
 
 		 530 aa  142  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.776559  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.21 
 
 		 635 aa  142  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1833  hypothetical protein  27.91 
 
 		 616 aa  142  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  25.05 
 
 		 531 aa  142  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2511  ABC transporter, ATP-binding protein  27.96 
 
 		 646 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.271255  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2455  ABC transporter, ATP-binding protein  27.96 
 
 		 646 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242369  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2068  ABC transporter related  27.05 
 
 		 643 aa  142  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  26.98 
 
 		 692 aa  142  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69340  putative ATP-binding component of ABC transporter  26.42 
 
 		 638 aa  142  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  26.1 
 
 		 636 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  28.29 
 
 		 635 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  28.26 
 
 		 646 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  28.96 
 
 		 637 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  26.24 
 
 		 627 aa  140  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  26.24 
 
 		 610 aa  140  8.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  29.74 
 
 		 624 aa  140  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2753  ABC transporter related  24.41 
 
 		 530 aa  140  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1517  ABC transporter related protein  24.62 
 
 		 530 aa  140  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28710  ABC transporter, ATP binding component  25.38 
 
 		 521 aa  139  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  26.6 
 
 		 654 aa  139  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  27.8 
 
 		 637 aa  139  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  26.46 
 
 		 640 aa  139  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  29.02 
 
 		 637 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  29.02 
 
 		 637 aa  139  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  29.02 
 
 		 637 aa  139  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>