More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA00950 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06651  mRNA-nucleus export ATPase (Elf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03580)  44.38 
 
 		 1118 aa  822    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00950  mRNA export factor elf1, putative  100 
 
 		 1100 aa  2265    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.484404  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02420  elongation factor 3  39.61 
 
 		 1055 aa  654    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.103235  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90176  translation elongation factor  40.26 
 
 		 1048 aa  644    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.902447  normal  0.536047 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89073  predicted protein  40.89 
 
 		 1031 aa  637    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161283  normal  0.722598 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88728  predicted protein  43.38 
 
 		 1141 aa  856    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal  0.12515 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45865  predicted protein  40.58 
 
 		 923 aa  613  9.999999999999999e-175  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.80899  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06700  elongation factor 3 (Eurofung)  40.27 
 
 		 917 aa  582  1e-164  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.617822 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27838  predicted protein  37.24 
 
 		 1040 aa  582  1e-164  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36160  predicted protein  31.04 
 
 		 995 aa  429  1e-118  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9372  predicted protein  43.52 
 
 		 504 aa  420  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35279  predicted protein  36.23 
 
 		 528 aa  333  8e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  31.9 
 
 		 527 aa  195  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04315  ABC transporter, putative (Eurofung)  30.8 
 
 		 751 aa  187  1.0000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.21831 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  30.05 
 
 		 521 aa  177  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  30.14 
 
 		 623 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  30.83 
 
 		 657 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  28.88 
 
 		 625 aa  172  4e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1376  ABC transporter ATP-binding protein  30.13 
 
 		 676 aa  171  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  29.48 
 
 		 650 aa  169  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  29.37 
 
 		 557 aa  169  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  31.31 
 
 		 635 aa  169  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  34.95 
 
 		 732 aa  167  8e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2010  ABC transporter, ATP-binding protein  28.81 
 
 		 646 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2600  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 646 aa  166  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0562857  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  30.05 
 
 		 533 aa  166  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  29.47 
 
 		 645 aa  165  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  28.47 
 
 		 609 aa  165  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2455  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 646 aa  165  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2511  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 646 aa  165  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.271255  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  28.85 
 
 		 610 aa  164  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  29.37 
 
 		 692 aa  164  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1572  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 646 aa  164  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.50284  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1347  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 646 aa  164  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3237  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 646 aa  164  9e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660205  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2075  ABC transporter, ATP-binding protein  28.57 
 
 		 646 aa  164  9e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.491633  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  30.83 
 
 		 624 aa  164  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.51 
 
 		 637 aa  162  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  30.12 
 
 		 637 aa  162  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  30.12 
 
 		 637 aa  162  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.12 
 
 		 637 aa  162  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1830  hypothetical protein  30.43 
 
 		 616 aa  162  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.27 
 
 		 637 aa  162  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  30.12 
 
 		 637 aa  162  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.12 
 
 		 637 aa  162  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.12 
 
 		 637 aa  162  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.12 
 
 		 637 aa  162  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  28.57 
 
 		 643 aa  162  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  30.87 
 
 		 636 aa  161  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3861  ABC transporter-related protein  30.62 
 
 		 636 aa  161  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  29.19 
 
 		 627 aa  161  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.35 
 
 		 640 aa  160  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  30.9 
 
 		 635 aa  160  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.35 
 
 		 640 aa  160  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  29.04 
 
 		 640 aa  160  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  30.35 
 
 		 640 aa  160  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2055  ABC transporter related  29.7 
 
 		 643 aa  160  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.035925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3393  ABC transporter related  31.59 
 
 		 637 aa  159  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1833  hypothetical protein  30.43 
 
 		 616 aa  159  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5345  ABC transporter, fused ATPase subunits  29.44 
 
 		 643 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2041  ABC transporter related  29.37 
 
 		 651 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  29.15 
 
 		 643 aa  160  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68683  ATP-binding cassette (ABC) family, regulator of translational elongation  28.41 
 
 		 752 aa  159  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.525981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  29.1 
 
 		 646 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6041  ABC transporter related  29.7 
 
 		 643 aa  160  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0741  ABC transporter related  31.59 
 
 		 637 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3281  ABC transporter related  31.59 
 
 		 637 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  29.95 
 
 		 672 aa  159  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2036  ABC transporter related  29.7 
 
 		 643 aa  160  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252943  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  29.03 
 
 		 630 aa  158  4e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  28.68 
 
 		 627 aa  158  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3136  ABC transporter related  29.37 
 
 		 644 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  28.12 
 
 		 642 aa  158  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3138  ABC transporter related  29.62 
 
 		 621 aa  158  7e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00577211  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  28.5 
 
 		 651 aa  157  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  29.88 
 
 		 656 aa  157  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0472  ABC transporter related  29.29 
 
 		 541 aa  157  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  30.6 
 
 		 636 aa  157  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  28.24 
 
 		 636 aa  156  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  29.83 
 
 		 654 aa  156  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  29.95 
 
 		 657 aa  156  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  29.62 
 
 		 641 aa  156  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.82 
 
 		 639 aa  156  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  28.33 
 
 		 648 aa  155  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0885  ABC transporter, ATP-binding protein  30.45 
 
 		 637 aa  155  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3117  ABC transporter related  30.35 
 
 		 636 aa  155  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  28.5 
 
 		 615 aa  155  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  27.35 
 
 		 540 aa  155  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2480  ABC transporter-related protein  27.81 
 
 		 676 aa  155  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3476  ABC transporter related  30.35 
 
 		 637 aa  155  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0863  ABC transporter related  30.35 
 
 		 637 aa  155  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0899  ABC transporter related  30.35 
 
 		 637 aa  155  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  28.21 
 
 		 627 aa  155  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  31.22 
 
 		 631 aa  154  7e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1808  ABC transporter related  27.81 
 
 		 672 aa  154  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.762366 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2068  ABC transporter related  28.89 
 
 		 643 aa  154  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  29.59 
 
 		 634 aa  154  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.13 
 
 		 635 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.13 
 
 		 635 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.13 
 
 		 635 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>