More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_89073 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001301  ANIA_06651  mRNA-nucleus export ATPase (Elf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03580)  41.56 
 
 
1118 aa  671    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06700  elongation factor 3 (Eurofung)  43.74 
 
 
917 aa  753    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.617822 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00950  mRNA export factor elf1, putative  39.01 
 
 
1100 aa  657    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.484404  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02420  elongation factor 3  43.79 
 
 
1055 aa  765    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.103235  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89073  predicted protein  100 
 
 
1031 aa  2143    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161283  normal  0.722598 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45865  predicted protein  46.39 
 
 
923 aa  766    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.80899  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27838  predicted protein  45.26 
 
 
1040 aa  751    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88728  predicted protein  37.5 
 
 
1141 aa  671    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal  0.12515 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90176  translation elongation factor  46.69 
 
 
1048 aa  806    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.902447  normal  0.536047 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9372  predicted protein  44.06 
 
 
504 aa  434  1e-120  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35279  predicted protein  39.85 
 
 
528 aa  390  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169231  hitchhiker  0.00726349 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36160  predicted protein  37.7 
 
 
995 aa  390  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_51174  predicted protein  29.3 
 
 
623 aa  180  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00520  regulation of translational elongation-related protein, putative  30.07 
 
 
732 aa  180  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45085  predicted protein  29.38 
 
 
533 aa  179  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.11187 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12095  frustulin 5  29.37 
 
 
521 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89162  ABC transporter  28.74 
 
 
609 aa  174  9e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10367  predicted protein  29.19 
 
 
527 aa  171  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00300  ATP-binding cassette (ABC) transporter, putative  27.42 
 
 
625 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.681189  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12543  predicted protein  29.25 
 
 
557 aa  165  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0560437  normal  0.0167575 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3634  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.72 
 
 
637 aa  164  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000338837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3727  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 
637 aa  164  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.577827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03203  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  29.41 
 
 
637 aa  164  7e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0823398  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0360  ABC transporter related protein  29.41 
 
 
637 aa  164  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3549  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 
637 aa  164  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.309193  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3822  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 
637 aa  164  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000840845  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03155  hypothetical protein  29.41 
 
 
637 aa  164  7e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0843095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0360  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 
637 aa  164  7e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4662  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.41 
 
 
637 aa  164  7e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0192611  normal  0.11448 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3764  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.22 
 
 
635 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.460675 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0719  ABC transporter related  29.9 
 
 
672 aa  160  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.76998  hitchhiker  0.00730908 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3656  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.22 
 
 
635 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3729  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.22 
 
 
635 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83809  normal  0.145902 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0264  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.19 
 
 
640 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3689  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.19 
 
 
640 aa  159  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3932  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.19 
 
 
640 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3827  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.22 
 
 
635 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43066  predicted protein  29.79 
 
 
631 aa  158  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0251063  normal  0.287268 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3655  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.97 
 
 
635 aa  157  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  29.76 
 
 
624 aa  157  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3770  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.9 
 
 
634 aa  157  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.605767  hitchhiker  0.00540958 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1830  hypothetical protein  32.13 
 
 
616 aa  156  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0052  ABC transporter  28.46 
 
 
636 aa  155  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0375  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.57 
 
 
637 aa  155  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  29.68 
 
 
635 aa  155  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2617  ABC transporter related  27.46 
 
 
543 aa  155  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0118157  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0138  ABC transporter, ATP-binding protein  28.28 
 
 
651 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  27.1 
 
 
627 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3309  ABC transporter related  28.36 
 
 
542 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000132577  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6484  ABC transporter related  29.44 
 
 
540 aa  154  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  30.08 
 
 
672 aa  154  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0758588 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02210  ABC transporter (Eurofung)  28.96 
 
 
610 aa  154  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.177403  normal  0.0978549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4562  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.15 
 
 
637 aa  154  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.673665 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  28.42 
 
 
636 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3847  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.32 
 
 
635 aa  152  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4027  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.32 
 
 
635 aa  153  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.963749  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0299  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.82 
 
 
639 aa  152  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1833  hypothetical protein  31.62 
 
 
616 aa  151  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3690  ABC transporter, ATPase subunit  29.44 
 
 
599 aa  151  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1536  ABC transporter related  27.59 
 
 
540 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.28069e-34 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  26.64 
 
 
627 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5700  ABC transporter, fused ATPase subunits  27.23 
 
 
649 aa  149  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47520  ABC transporter , ATP-binding protein  27.12 
 
 
633 aa  149  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2091  ABC transporter related  26.98 
 
 
627 aa  149  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105315 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  27.41 
 
 
645 aa  149  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  28.9 
 
 
645 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1174  ABC transporter related  28.12 
 
 
654 aa  148  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  27.41 
 
 
692 aa  148  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  26.35 
 
 
627 aa  148  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  27.36 
 
 
642 aa  148  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0770  ABC transporter related  26.59 
 
 
629 aa  148  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0943746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2704  ABC transporter related protein  27.59 
 
 
540 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00040333  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1376  ABC transporter ATP-binding protein  27.23 
 
 
676 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636737  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41659  predicted protein  26.37 
 
 
645 aa  148  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.666462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5478  ABC transporter-like  28.94 
 
 
636 aa  148  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.882087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2524  ABC transporter-related protein  26.58 
 
 
544 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107445  normal  0.0506858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0196  ABC transporter ATP-binding protein  29 
 
 
636 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466605  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0576  ABC transporter related  28.43 
 
 
540 aa  147  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0289  ABC transporter related  28.01 
 
 
636 aa  147  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3340  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  27.9 
 
 
645 aa  147  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.790276  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0217  ABC transporter related  29 
 
 
636 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.631932  normal  0.82416 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2338  ABC transporter related protein  29.72 
 
 
635 aa  147  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2425  ABC transporter related  28.32 
 
 
540 aa  146  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.410607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0473  ABC transporter related  27.36 
 
 
648 aa  145  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1673  ABC transporter, ATPase subunit  27.56 
 
 
625 aa  145  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2336  ABC transporter related  27.32 
 
 
625 aa  145  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.590481  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2157  ABC transporter, duplicated ATPase subunits  28.87 
 
 
548 aa  145  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  26.53 
 
 
640 aa  145  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2484  ABC transporter related  27.08 
 
 
625 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.814906  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1943  ABC transporter, fused ATPase subunits  27.73 
 
 
530 aa  144  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002693  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  28.03 
 
 
528 aa  144  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1549  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  25.54 
 
 
639 aa  144  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0265  ABC transporter related  28.83 
 
 
636 aa  144  8e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2970  ABC transporter related  29.44 
 
 
540 aa  144  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2279  ABC transporter related  27.23 
 
 
649 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2315  ABC transporter related  27.49 
 
 
530 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0855999 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  25.64 
 
 
636 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2877  ABC transporter related  28.21 
 
 
621 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.358823  normal  0.296098 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0220  ABC transporter related  29.92 
 
 
615 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0324  ABC transporter related  27.27 
 
 
659 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.843371  normal  0.526275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>