17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_84618 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_10734  translational activator, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07960)  38.26 
 
 		 2672 aa  1708    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257702 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49748  predicted protein  32.81 
 
 		 2821 aa  656    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02430  regulation of translational elongation-related protein, putative  36.2 
 
 		 2611 aa  1335    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_81  predicted protein  36.63 
 
 		 1330 aa  689    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.267422 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84618  GCN1; translational activator of GCN4  100 
 
 		 2721 aa  5494    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36160  predicted protein  32.93 
 
 		 995 aa  178  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02420  elongation factor 3  30.45 
 
 		 1055 aa  114  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.103235  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44942  predicted protein  28.21 
 
 		 556 aa  106  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90176  translation elongation factor  28.52 
 
 		 1048 aa  101  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.902447  normal  0.536047 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45865  predicted protein  30.69 
 
 		 923 aa  89.4  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.80899  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00950  mRNA export factor elf1, putative  26.64 
 
 		 1100 aa  86.3  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.484404  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27838  predicted protein  28.41 
 
 		 1040 aa  84.7  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89073  predicted protein  27.98 
 
 		 1031 aa  78.6  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161283  normal  0.722598 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06700  elongation factor 3 (Eurofung)  30.83 
 
 		 917 aa  51.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.617822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  21.61 
 
 		 1328 aa  50.4  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88728  predicted protein  22.18 
 
 		 1141 aa  48.5  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal  0.12515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  26.05 
 
 		 838 aa  47.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>