16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44942 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44942  predicted protein  100 
 
 		 556 aa  1123    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02420  elongation factor 3  34.7 
 
 		 1055 aa  136  9e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.103235  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90176  translation elongation factor  37.67 
 
 		 1048 aa  135  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.902447  normal  0.536047 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00950  mRNA export factor elf1, putative  31.78 
 
 		 1100 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.484404  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_81  predicted protein  31.94 
 
 		 1330 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.267422 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02430  regulation of translational elongation-related protein, putative  30.57 
 
 		 2611 aa  114  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49748  predicted protein  28.31 
 
 		 2821 aa  110  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84618  GCN1; translational activator of GCN4  27.22 
 
 		 2721 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27838  predicted protein  34.39 
 
 		 1040 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36160  predicted protein  28.46 
 
 		 995 aa  107  6e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45865  predicted protein  32.43 
 
 		 923 aa  107  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.80899  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06700  elongation factor 3 (Eurofung)  35.9 
 
 		 917 aa  96.3  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.617822 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88728  predicted protein  26.39 
 
 		 1141 aa  90.9  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal  0.12515 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06651  mRNA-nucleus export ATPase (Elf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03580)  28.22 
 
 		 1118 aa  89.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10734  translational activator, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07960)  25 
 
 		 2672 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.257702 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89073  predicted protein  26.69 
 
 		 1031 aa  76.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161283  normal  0.722598 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>