17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_81 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_84618  GCN1; translational activator of GCN4  36.63 
 
 
2721 aa  714    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49748  predicted protein  37.06 
 
 
2821 aa  745    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_81  predicted protein  100 
 
 
1330 aa  2680    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.267422 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02430  regulation of translational elongation-related protein, putative  39.94 
 
 
2611 aa  818    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10734  translational activator, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07960)  37.05 
 
 
2672 aa  702    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257702 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36160  predicted protein  40.48 
 
 
995 aa  243  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02420  elongation factor 3  33.77 
 
 
1055 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.103235  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44942  predicted protein  31.94 
 
 
556 aa  121  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90176  translation elongation factor  32.54 
 
 
1048 aa  114  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.902447  normal  0.536047 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_45865  predicted protein  34.55 
 
 
923 aa  108  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.80899  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89073  predicted protein  31.29 
 
 
1031 aa  107  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.161283  normal  0.722598 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27838  predicted protein  33.63 
 
 
1040 aa  96.3  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00950  mRNA export factor elf1, putative  27.5 
 
 
1100 aa  95.5  6e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.484404  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88728  predicted protein  22.89 
 
 
1141 aa  79.3  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.690875  normal  0.12515 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06651  mRNA-nucleus export ATPase (Elf1), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03580)  24.27 
 
 
1118 aa  76.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06700  elongation factor 3 (Eurofung)  38.69 
 
 
917 aa  74.3  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.617822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  23.6 
 
 
1328 aa  54.7  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>