More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB00380 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB00380  seryl-tRNA synthetase, putative  100 
 
 		 506 aa  1043    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37135  predicted protein  39.2 
 
 		 502 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000503836  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 424 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10353  beta-1,4-glucosidase/seryl tRNA synthase (Eurofung)  37.25 
 
 		 478 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2307  seryl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000241726  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_60912  seryl-tRNA synthase-like protein  37.44 
 
 		 465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0842  seryl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 452 aa  272  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 425 aa  266  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 425 aa  246  4.9999999999999997e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 420 aa  239  8e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 418 aa  237  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  36.6 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  36.64 
 
 		 421 aa  233  9e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1503  seryl-tRNA synthetase  34.25 
 
 		 424 aa  232  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000981154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 425 aa  230  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 436 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  35.13 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 411 aa  226  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 422 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  35.94 
 
 		 424 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  34.24 
 
 		 433 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  31.58 
 
 		 421 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0349  seryl-tRNA synthetase  33.8 
 
 		 442 aa  216  8e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  32.55 
 
 		 424 aa  216  9e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  32.63 
 
 		 425 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  32.24 
 
 		 428 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 423 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  31.68 
 
 		 420 aa  213  7.999999999999999e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  32.76 
 
 		 425 aa  211  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 417 aa  211  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 426 aa  210  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 426 aa  210  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 445 aa  209  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  32.56 
 
 		 425 aa  209  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  32.15 
 
 		 428 aa  209  9e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  33.66 
 
 		 425 aa  209  9e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  34.13 
 
 		 426 aa  209  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 416 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0102  seryl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 428 aa  208  2e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  31.33 
 
 		 421 aa  208  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2702  seryl-tRNA synthetase  31.56 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.616472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  35.27 
 
 		 419 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  32.01 
 
 		 427 aa  207  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 417 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  35.38 
 
 		 417 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  34.51 
 
 		 426 aa  206  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0968  seryl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 430 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 430 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1028  seryl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 430 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  33.08 
 
 		 425 aa  206  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  30.28 
 
 		 430 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  35.13 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  29.63 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  32.92 
 
 		 424 aa  205  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1417  seryl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 430 aa  205  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  29.63 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 428 aa  205  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  31.3 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  33.58 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  31.63 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  30.07 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  32.9 
 
 		 425 aa  204  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  34.6 
 
 		 422 aa  203  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  30.72 
 
 		 428 aa  203  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  33.58 
 
 		 424 aa  203  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  32.58 
 
 		 422 aa  203  6e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  30 
 
 		 435 aa  203  6e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1952  seryl-tRNA synthetase  31.34 
 
 		 455 aa  202  8e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3604  seryl-tRNA synthetase  30.53 
 
 		 423 aa  202  8e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 424 aa  202  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  29.85 
 
 		 428 aa  202  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1077  seryl-tRNA synthetase  30.91 
 
 		 430 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  32.17 
 
 		 436 aa  202  9.999999999999999e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  32.78 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  31.47 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1339  seryl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0130081  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  31.65 
 
 		 426 aa  201  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  28.88 
 
 		 428 aa  201  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1278  seryl-tRNA synthetase  30.11 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.483732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  33.08 
 
 		 424 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 424 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  30.73 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1167  seryl-tRNA synthetase  31.83 
 
 		 427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0695975  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  29.41 
 
 		 428 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>