More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60912 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_60912  seryl-tRNA synthase-like protein  100 
 
 		 465 aa  962    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10353  beta-1,4-glucosidase/seryl tRNA synthase (Eurofung)  41.04 
 
 		 478 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37135  predicted protein  40.61 
 
 		 502 aa  295  9e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000503836  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 425 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2307  seryl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000241726  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 425 aa  270  4e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 424 aa  262  8.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0842  seryl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 452 aa  259  8e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00380  seryl-tRNA synthetase, putative  37.44 
 
 		 506 aa  258  1e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 421 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 427 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  35.35 
 
 		 435 aa  242  1e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  35.63 
 
 		 424 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 423 aa  239  8e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 424 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  35.09 
 
 		 420 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  35.25 
 
 		 424 aa  236  6e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  33.17 
 
 		 421 aa  236  6e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  35.25 
 
 		 424 aa  236  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  34.94 
 
 		 424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  36.39 
 
 		 420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  32.95 
 
 		 435 aa  234  3e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  34.09 
 
 		 426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  34.4 
 
 		 426 aa  233  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2178  seryl-tRNA synthetase  34.36 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 421 aa  232  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 424 aa  231  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 424 aa  230  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  35.44 
 
 		 423 aa  230  4e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 433 aa  229  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 426 aa  229  9e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0367  seryl-tRNA synthetase  34.83 
 
 		 459 aa  228  1e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1764  seryl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 451 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  35.94 
 
 		 426 aa  227  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 425 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  34.1 
 
 		 424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  34.35 
 
 		 427 aa  226  6e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  34.18 
 
 		 427 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 426 aa  226  8e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  33.49 
 
 		 416 aa  226  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0744  seryl-tRNA synthetase  35.33 
 
 		 461 aa  225  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124446  normal  0.521424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  33.02 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  33.18 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  34.33 
 
 		 424 aa  225  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 427 aa  225  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  34.95 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  33.95 
 
 		 427 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1503  seryl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000981154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 427 aa  223  6e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 436 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  32.13 
 
 		 424 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 425 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1952  seryl-tRNA synthetase  35.51 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  32.05 
 
 		 431 aa  221  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0440  seryl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 439 aa  221  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  34.15 
 
 		 425 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 422 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  33.66 
 
 		 425 aa  220  5e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 420 aa  219  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  33.78 
 
 		 428 aa  219  7e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  34.39 
 
 		 417 aa  219  7e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  33.26 
 
 		 422 aa  219  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  35 
 
 		 430 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 417 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 417 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  34.71 
 
 		 425 aa  219  1e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 417 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  33.59 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  32.87 
 
 		 425 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  32.64 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1426  seryl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  32.66 
 
 		 424 aa  217  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0424  seryl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 427 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  33.41 
 
 		 427 aa  217  4e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  33.63 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  33.72 
 
 		 422 aa  217  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 422 aa  217  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  35.03 
 
 		 422 aa  216  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2787  seryl-tRNA synthetase  34.16 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1342  seryl-tRNA synthetase  33.65 
 
 		 414 aa  216  7e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  34.97 
 
 		 424 aa  216  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0931  seryl-tRNA synthetase  34.57 
 
 		 431 aa  216  8e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0577  seryl-tRNA synthetase  34.46 
 
 		 413 aa  216  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>