More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0931 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  70.53 
 
 		 431 aa  645    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  74.88 
 
 		 427 aa  676    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0594  seryl-tRNA synthetase  77.75 
 
 		 430 aa  700    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0695  seryl-tRNA synthetase  79.81 
 
 		 426 aa  720    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0194542  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1823  seryl-tRNA synthetase  76.53 
 
 		 427 aa  678    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0931  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 431 aa  894    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  76.64 
 
 		 431 aa  687    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 422 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 422 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  52.36 
 
 		 422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 422 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 424 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 427 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 422 aa  438  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 424 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 420 aa  436  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 422 aa  438  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 425 aa  432  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  428  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  428  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 423 aa  428  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  428  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 423 aa  428  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 426 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  428  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 427 aa  420  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 424 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 423 aa  408  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 432 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 425 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 424 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  47.62 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1968  seryl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 426 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.355575  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 422 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 417 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 421 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 421 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 424 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 425 aa  389  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 413 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 425 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_002936  DET0577  seryl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 413 aa  382  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 438 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  45.17 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_516  seryl-tRNA synthetase  45.92 
 
 		 413 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1426  seryl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 426 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  45.35 
 
 		 426 aa  376  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 433 aa  375  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 426 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 426 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>