More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0118 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 416 aa  849    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  76.61 
 
 		 421 aa  665    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  70.91 
 
 		 418 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  69.62 
 
 		 420 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  71.23 
 
 		 426 aa  593  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  71.36 
 
 		 419 aa  589  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  70.81 
 
 		 421 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  70.75 
 
 		 426 aa  585  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  71.05 
 
 		 436 aa  587  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  71.53 
 
 		 422 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  70.17 
 
 		 422 aa  574  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  70.1 
 
 		 417 aa  571  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  72.97 
 
 		 417 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  72.97 
 
 		 417 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  72.97 
 
 		 417 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  68.47 
 
 		 426 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  68.51 
 
 		 425 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  68.31 
 
 		 426 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  70.57 
 
 		 445 aa  558  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  67.77 
 
 		 424 aa  559  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  70.1 
 
 		 419 aa  556  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  70.21 
 
 		 431 aa  557  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  69.45 
 
 		 420 aa  557  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  68.26 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  67.15 
 
 		 422 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  68.18 
 
 		 419 aa  535  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  66.35 
 
 		 426 aa  531  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  66.75 
 
 		 423 aa  529  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  65.71 
 
 		 423 aa  521  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  64.41 
 
 		 433 aa  524  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  61.47 
 
 		 428 aa  518  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  62.77 
 
 		 420 aa  512  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  60.28 
 
 		 428 aa  510  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  60.43 
 
 		 424 aa  489  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 425 aa  363  3e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 417 aa  349  5e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 424 aa  345  7e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 423 aa  342  5.999999999999999e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37135  predicted protein  44.13 
 
 		 502 aa  340  4e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000503836  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 424 aa  339  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 424 aa  339  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 424 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 426 aa  333  3e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 411 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 423 aa  330  2e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 421 aa  323  2e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 428 aa  322  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 428 aa  322  5e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 424 aa  322  6e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 425 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 424 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 422 aa  322  9.999999999999999e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2307  seryl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000241726  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 425 aa  320  1.9999999999999998e-86  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 435 aa  320  3e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  41 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  39 
 
 		 428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 431 aa  311  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 422 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 423 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 421 aa  310  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 425 aa  309  5e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 426 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1070  seryl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 421 aa  307  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 421 aa  307  3e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0842  seryl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 452 aa  307  3e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 423 aa  306  5.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 433 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 432 aa  306  6e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 422 aa  305  7e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>