More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1382 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 425 aa  864    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 424 aa  467  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2307  seryl-tRNA synthetase  54.01 
 
 		 422 aa  445  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000241726  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 425 aa  426  1e-118  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0842  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 452 aa  419  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37135  predicted protein  42.69 
 
 		 502 aa  368  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000503836  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 416 aa  358  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  41.65 
 
 		 420 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 418 aa  352  8e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 427 aa  352  8e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 433 aa  350  4e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 421 aa  348  8e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 421 aa  348  9e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 426 aa  347  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 424 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  42.56 
 
 		 428 aa  346  4e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 424 aa  345  8e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 417 aa  345  8e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  44.13 
 
 		 445 aa  345  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  44 
 
 		 425 aa  343  4e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 422 aa  343  4e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  342  5e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 425 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 425 aa  342  7e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 424 aa  342  9e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 426 aa  341  1e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 417 aa  341  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 424 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 425 aa  340  2e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  41.51 
 
 		 436 aa  340  4e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 422 aa  336  5.999999999999999e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 426 aa  335  7.999999999999999e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 422 aa  335  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 419 aa  334  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 420 aa  333  5e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 419 aa  332  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 420 aa  331  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 422 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 428 aa  330  4e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 428 aa  330  4e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 423 aa  330  4e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 419 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 421 aa  325  9e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 427 aa  323  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 426 aa  322  9.999999999999999e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 426 aa  322  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 427 aa  322  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 425 aa  320  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 424 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 417 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 433 aa  319  5e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 413 aa  318  7.999999999999999e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 423 aa  318  9e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 427 aa  318  9e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 425 aa  318  1e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 422 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 420 aa  318  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 427 aa  317  3e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 435 aa  316  4e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 423 aa  316  4e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 422 aa  317  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 		 423 aa  315  7e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1952  seryl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 455 aa  315  7e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 426 aa  315  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_516  seryl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 413 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>