More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06830 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 423 aa  860    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  70.59 
 
 		 424 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  67.92 
 
 		 426 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  66.35 
 
 		 426 aa  556  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  67.14 
 
 		 422 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  65.8 
 
 		 418 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  66.04 
 
 		 426 aa  535  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  64.45 
 
 		 420 aa  533  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  65.71 
 
 		 416 aa  530  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  67.37 
 
 		 431 aa  531  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  64.17 
 
 		 426 aa  524  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  63.27 
 
 		 421 aa  526  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  64.99 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 436 aa  511  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  59.67 
 
 		 428 aa  502  1e-141  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  64.13 
 
 		 421 aa  504  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  64.1 
 
 		 427 aa  502  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  60.56 
 
 		 425 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  58.96 
 
 		 428 aa  503  1e-141  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  64.32 
 
 		 426 aa  499  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  64.29 
 
 		 419 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  61.76 
 
 		 420 aa  494  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  63.29 
 
 		 417 aa  491  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  62.56 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  63.36 
 
 		 422 aa  476  1e-133  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  60 
 
 		 433 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 422 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  63.1 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  58.6 
 
 		 420 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  61.76 
 
 		 419 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  57.78 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  60.81 
 
 		 419 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 425 aa  322  8e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 411 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 427 aa  313  4.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 423 aa  309  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  42.34 
 
 		 420 aa  308  8e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 421 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 424 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 423 aa  301  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 424 aa  298  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 424 aa  296  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 425 aa  296  4e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 424 aa  296  7e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 424 aa  296  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 424 aa  296  7e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 424 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 424 aa  296  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 424 aa  295  8e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 422 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  38.85 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 422 aa  292  7e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 421 aa  291  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  41 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 423 aa  290  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 428 aa  289  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 428 aa  289  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 423 aa  288  9e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  41 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 428 aa  287  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 431 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  42 
 
 		 425 aa  286  5e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 425 aa  286  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 426 aa  286  5.999999999999999e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 423 aa  285  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3636  seryl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 413 aa  283  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000529029 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 427 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 427 aa  283  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13891  seryl-tRNA synthetase  35.31 
 
 		 425 aa  282  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13811  seryl-tRNA synthetase  35.55 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 424 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 427 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 422 aa  281  2e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37135  predicted protein  39.09 
 
 		 502 aa  281  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000503836  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 425 aa  281  2e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 431 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 433 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>