More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0265 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 426 aa  873    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  75.3 
 
 		 422 aa  635    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  73.82 
 
 		 424 aa  645    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  71.26 
 
 		 426 aa  608  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  69.48 
 
 		 423 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  65.65 
 
 		 421 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  68.31 
 
 		 416 aa  559  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  66.12 
 
 		 426 aa  555  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  66.59 
 
 		 426 aa  552  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  66.12 
 
 		 418 aa  550  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  68.31 
 
 		 431 aa  548  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  65.41 
 
 		 420 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  65.88 
 
 		 426 aa  547  1e-154  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  66.35 
 
 		 423 aa  545  1e-154  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  62.06 
 
 		 428 aa  541  1e-153  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  65.41 
 
 		 421 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  64.55 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  61.12 
 
 		 428 aa  533  1e-150  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  64.64 
 
 		 436 aa  525  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  60.75 
 
 		 425 aa  522  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  64.39 
 
 		 420 aa  520  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  64.32 
 
 		 419 aa  521  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 417 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  64.24 
 
 		 422 aa  510  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  61.41 
 
 		 445 aa  502  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  63.47 
 
 		 422 aa  502  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  61.59 
 
 		 419 aa  497  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  62.35 
 
 		 419 aa  497  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  59.86 
 
 		 433 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  61.88 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  61.88 
 
 		 417 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  61.88 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  58.78 
 
 		 420 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  59.15 
 
 		 424 aa  481  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 425 aa  336  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 425 aa  323  5e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  40.65 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 423 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 411 aa  313  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 423 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 425 aa  312  7.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 423 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 423 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 425 aa  310  4e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 422 aa  309  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 435 aa  308  2.0000000000000002e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 424 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 422 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 424 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 424 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 424 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 424 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 424 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 424 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 423 aa  302  6.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 422 aa  302  9e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 424 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 425 aa  300  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 428 aa  299  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 422 aa  299  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 428 aa  299  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 426 aa  299  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 423 aa  299  7e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 420 aa  298  9e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  37.06 
 
 		 428 aa  297  3e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 425 aa  296  6e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  37.12 
 
 		 421 aa  295  9e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 425 aa  295  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 422 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37135  predicted protein  40 
 
 		 502 aa  293  4e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000503836  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 425 aa  293  5e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 426 aa  293  5e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 422 aa  292  8e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 427 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 423 aa  289  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0577  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 413 aa  289  8e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 421 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>