More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2507 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  74.35 
 
 		 425 aa  677    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  75.53 
 
 		 425 aa  686    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  69.65 
 
 		 425 aa  639    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 425 aa  883    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 421 aa  438  1e-121  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1952  seryl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 455 aa  384  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0349  seryl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 424 aa  364  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 425 aa  363  2e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0408  seryl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 452 aa  363  3e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 424 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  45 
 
 		 421 aa  362  5.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 425 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 424 aa  360  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 425 aa  360  3e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 424 aa  359  4e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 424 aa  360  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 423 aa  358  8e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 423 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 428 aa  356  5e-97  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 420 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 424 aa  355  7.999999999999999e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 421 aa  355  8.999999999999999e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  44.94 
 
 		 427 aa  353  4e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 427 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 427 aa  351  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 427 aa  350  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 425 aa  350  2e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 422 aa  350  2e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  42.32 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 424 aa  347  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 426 aa  346  5e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 425 aa  346  6e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1666  seryl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 457 aa  343  2e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 424 aa  343  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0581  seryl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.547336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 426 aa  341  1e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 431 aa  340  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 431 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1115  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 		 425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 423 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 423 aa  338  8e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 426 aa  338  9e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 432 aa  338  9e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 438 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 427 aa  336  3.9999999999999995e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 423 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0180  seryl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 456 aa  335  1e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 433 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 424 aa  333  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 433 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1667  seryl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 463 aa  332  6e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.146167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 433 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 426 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 433 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 426 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 426 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 421 aa  332  9e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 435 aa  332  9e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 433 aa  331  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 433 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 426 aa  330  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3183  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 426 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 432 aa  329  7e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>