More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0278 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 433 aa  869    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  64.52 
 
 		 421 aa  542  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  64.76 
 
 		 421 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  61.43 
 
 		 420 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  64.41 
 
 		 416 aa  518  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  65.48 
 
 		 420 aa  513  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 417 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 425 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  65.95 
 
 		 419 aa  508  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  64.89 
 
 		 445 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  66.43 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  66.43 
 
 		 417 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  65.95 
 
 		 419 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  61.9 
 
 		 418 aa  501  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  61.5 
 
 		 426 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  65.13 
 
 		 436 aa  498  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  61.7 
 
 		 424 aa  497  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 426 aa  497  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  62.95 
 
 		 420 aa  498  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  61.74 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  59.86 
 
 		 426 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  63.03 
 
 		 422 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  63.68 
 
 		 422 aa  485  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  60.33 
 
 		 422 aa  486  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  63.18 
 
 		 423 aa  487  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 419 aa  484  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  62.03 
 
 		 431 aa  482  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  59.39 
 
 		 426 aa  479  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 427 aa  477  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  60 
 
 		 423 aa  465  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 424 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  52.36 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 426 aa  443  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 425 aa  350  4e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 424 aa  342  8e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 421 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  43.5 
 
 		 427 aa  335  7.999999999999999e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 411 aa  335  1e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 435 aa  334  2e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 424 aa  333  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 424 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 424 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 424 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 424 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 424 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 424 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 424 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 417 aa  332  1e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 425 aa  328  8e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 425 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37135  predicted protein  40.85 
 
 		 502 aa  325  9e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000503836  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 428 aa  324  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 424 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 428 aa  324  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 423 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 425 aa  323  4e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 426 aa  322  7e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 423 aa  320  3e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 422 aa  320  3.9999999999999996e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 425 aa  319  7e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0934  seryl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160638  normal  0.296979 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 422 aa  316  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 425 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 422 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 427 aa  312  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 425 aa  310  2e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 421 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 421 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 425 aa  310  4e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 425 aa  310  5e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 421 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 426 aa  309  8e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 427 aa  308  9e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 431 aa  308  9e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 426 aa  308  9e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  40.71 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  41 
 
 		 469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  41 
 
 		 427 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 426 aa  308  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0842  seryl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 452 aa  307  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 426 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  38.98 
 
 		 432 aa  307  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2665  seryl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 427 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>