More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0710 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  74.35 
 
 
425 aa  677    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 
425 aa  885    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  72.24 
 
 
425 aa  658    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  68.47 
 
 
425 aa  621  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  46.32 
 
 
421 aa  397  1e-109  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0349  seryl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
442 aa  360  3e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
424 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
423 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1952  seryl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
455 aa  351  1e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
420 aa  348  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
422 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  44 
 
 
421 aa  346  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
424 aa  345  6e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
428 aa  345  8.999999999999999e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0408  seryl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
452 aa  344  2e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  44 
 
 
425 aa  343  4e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
424 aa  342  8e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
425 aa  341  1e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
425 aa  341  2e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
424 aa  341  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
421 aa  341  2e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  42.96 
 
 
427 aa  341  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
424 aa  340  4e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
424 aa  339  4e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
424 aa  339  4e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
424 aa  339  4e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  44.39 
 
 
425 aa  340  4e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
424 aa  339  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
424 aa  339  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
424 aa  338  9e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
424 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  43.53 
 
 
427 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
422 aa  335  5.999999999999999e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
425 aa  335  9e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
423 aa  335  1e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0581  seryl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
429 aa  333  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.547336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  44.05 
 
 
423 aa  334  2e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
426 aa  333  4e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
424 aa  332  7.000000000000001e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
427 aa  330  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  44.21 
 
 
427 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
424 aa  329  7e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
425 aa  329  7e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
428 aa  328  8e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
433 aa  328  8e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
428 aa  328  8e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  41.69 
 
 
423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1850  seryl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
428 aa  326  6e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
424 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1666  seryl-tRNA synthetase  40.59 
 
 
457 aa  325  1e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  40.09 
 
 
427 aa  325  1e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
425 aa  323  3e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
425 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
425 aa  323  4e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  38.39 
 
 
427 aa  322  5e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  40.46 
 
 
432 aa  322  7e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
421 aa  322  9.000000000000001e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  40.23 
 
 
431 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
425 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
426 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
433 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
424 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
428 aa  319  5e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
428 aa  319  6e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
431 aa  319  7e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
426 aa  318  9e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  38.39 
 
 
433 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
426 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
431 aa  318  1e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  39.16 
 
 
426 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
433 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0528  seryl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
448 aa  318  1e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.784578  normal  0.0294424 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
426 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
433 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
433 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
433 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
425 aa  318  2e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
433 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
427 aa  317  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3183  seryl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
425 aa  316  5e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
428 aa  315  8e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
423 aa  315  8e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
423 aa  315  8e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
427 aa  315  8e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1115  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 
425 aa  315  9e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1036  seryl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
427 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
432 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  38.5 
 
 
435 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
426 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
433 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1823  seryl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0692  seryl-tRNA synthetase  38 
 
 
431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>