More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1433 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  72.24 
 
 		 425 aa  658    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 425 aa  881    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  75.53 
 
 		 425 aa  686    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  68.71 
 
 		 425 aa  623  1e-177  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 421 aa  422  1e-117  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 424 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0408  seryl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 452 aa  360  2e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  44.58 
 
 		 427 aa  358  9.999999999999999e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 420 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 422 aa  355  6.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 425 aa  354  2e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 423 aa  352  5e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 435 aa  352  1e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0349  seryl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 442 aa  351  1e-95  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 423 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1952  seryl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  42.92 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  346  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 424 aa  346  4e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 425 aa  346  5e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  346  6e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  345  7e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  345  7e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  345  7e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  345  7e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  345  7e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 428 aa  342  5.999999999999999e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 425 aa  342  7e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 425 aa  342  1e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 421 aa  340  4e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 423 aa  340  4e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 424 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 425 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 421 aa  335  9e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 425 aa  335  9e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 425 aa  335  9e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0581  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 429 aa  335  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.547336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  41.26 
 
 		 427 aa  332  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 426 aa  331  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3183  seryl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 424 aa  332  1e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1115  seryl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 426 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 424 aa  330  4e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 421 aa  330  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1667  seryl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 463 aa  330  4e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.146167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 424 aa  330  4e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1666  seryl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 457 aa  329  6e-89  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.600696  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 433 aa  329  6e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 427 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 426 aa  326  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 433 aa  325  8.000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 422 aa  325  9e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0528  seryl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 448 aa  325  9e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.784578  normal  0.0294424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 426 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 433 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 427 aa  323  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 433 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 435 aa  323  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2315  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 425 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00701941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 428 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 426 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0692  seryl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 431 aa  322  9.999999999999999e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1417  seryl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 438 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  40.57 
 
 		 425 aa  320  3.9999999999999996e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>