More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0842 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0842  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 452 aa  935    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  55.9 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2307  seryl-tRNA synthetase  52.12 
 
 		 422 aa  434  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000241726  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 425 aa  431  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 425 aa  403  1e-111  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37135  predicted protein  43.06 
 
 		 502 aa  383  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000503836  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 421 aa  329  8e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 422 aa  326  5e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 425 aa  323  5e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 421 aa  318  7.999999999999999e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 425 aa  315  9e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 428 aa  315  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 416 aa  309  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 436 aa  305  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 		 425 aa  305  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 421 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 423 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 427 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 422 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0811  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 425 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.016999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 469 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 426 aa  301  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  37 
 
 		 425 aa  299  9e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 422 aa  298  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 425 aa  298  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 426 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0424  seryl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 427 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 430 aa  297  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 424 aa  297  3e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 423 aa  296  4e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0968  seryl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1028  seryl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 430 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1077  seryl-tRNA synthetase  37 
 
 		 430 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 432 aa  295  9e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 424 aa  295  9e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1417  seryl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 430 aa  295  9e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  40 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1497  seryl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 426 aa  293  3e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 427 aa  294  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 442 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 426 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 422 aa  293  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 433 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 426 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 424 aa  293  5e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 424 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 424 aa  293  6e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 418 aa  293  6e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 423 aa  293  6e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 424 aa  293  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 424 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 426 aa  292  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 428 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 428 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 433 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  37.59 
 
 		 433 aa  292  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 428 aa  292  7e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 433 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 428 aa  292  9e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 428 aa  292  9e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 424 aa  292  9e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 428 aa  292  9e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 422 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3404  seryl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 426 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25013 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  37.21 
 
 		 430 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 423 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  36.56 
 
 		 428 aa  291  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 430 aa  291  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 421 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  35.66 
 
 		 429 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 420 aa  291  2e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  35.87 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  36.3 
 
 		 428 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 411 aa  290  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  36.71 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>