More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1497 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1497  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 426 aa  877    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  54.21 
 
 		 427 aa  463  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 422 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  54.16 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  52.38 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 427 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  53.77 
 
 		 421 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 430 aa  443  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  53.57 
 
 		 424 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  53.3 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 434 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2315  seryl-tRNA synthetase  51.87 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00701941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 435 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 423 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 423 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 427 aa  437  1e-121  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 423 aa  437  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 423 aa  438  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 422 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 433 aa  435  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 428 aa  435  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 420 aa  433  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  52.51 
 
 		 417 aa  434  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 424 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1850  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 428 aa  434  1e-120  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003876  seryl-tRNA synthetase  51.28 
 
 		 435 aa  431  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00729663  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 426 aa  433  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 423 aa  431  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1077  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 430 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  51.43 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  52.94 
 
 		 425 aa  431  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 433 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  50.69 
 
 		 438 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 421 aa  429  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  48.75 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01800  seryl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 427 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 423 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1990  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 431 aa  428  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2456  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 432 aa  429  1e-119  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00287072  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1844  seryl-tRNA synthetase  51.05 
 
 		 435 aa  430  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0308873  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 425 aa  428  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 433 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 422 aa  430  1e-119  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 439 aa  425  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 428 aa  425  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1028  seryl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  51.42 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0968  seryl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 423 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  52.37 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 433 aa  427  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 428 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 432 aa  428  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1697  seryl-tRNA synthetase  51.44 
 
 		 426 aa  425  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0685581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 422 aa  425  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 469 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 432 aa  428  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1075  seryl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 429 aa  428  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0171622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 428 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 428 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0628  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0256221  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 430 aa  427  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 428 aa  428  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1547  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 426 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  48.87 
 
 		 452 aa  424  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>