More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0245 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 425 aa  865    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  71.08 
 
 		 420 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  66.35 
 
 		 420 aa  559  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  67.22 
 
 		 418 aa  553  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  65.48 
 
 		 424 aa  553  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  66.82 
 
 		 421 aa  548  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  68.51 
 
 		 416 aa  549  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  64.86 
 
 		 421 aa  543  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  66.67 
 
 		 436 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  63.87 
 
 		 426 aa  535  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  64.08 
 
 		 424 aa  536  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  62.7 
 
 		 426 aa  532  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  62.7 
 
 		 427 aa  529  1e-149  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  63.85 
 
 		 426 aa  528  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  64.78 
 
 		 422 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  60.75 
 
 		 426 aa  522  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  65.65 
 
 		 431 aa  518  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  66.2 
 
 		 422 aa  518  1e-146  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  64 
 
 		 426 aa  515  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  61.47 
 
 		 433 aa  509  1e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  64.59 
 
 		 419 aa  510  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  64.37 
 
 		 423 aa  511  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  64.18 
 
 		 445 aa  503  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  62.98 
 
 		 417 aa  501  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  56.94 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  60.56 
 
 		 423 aa  488  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  65.8 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  65.8 
 
 		 417 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  65.57 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  62.68 
 
 		 419 aa  483  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 420 aa  480  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  55.53 
 
 		 428 aa  478  1e-134  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  62.97 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  61.03 
 
 		 422 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 411 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 428 aa  319  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 428 aa  319  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 423 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37135  predicted protein  41.2 
 
 		 502 aa  316  5e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000503836  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 425 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 423 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 424 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 424 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 424 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 424 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 424 aa  312  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 424 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 424 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1906  seryl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00949318  normal  0.789568 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 425 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 421 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 421 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 424 aa  306  6e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 426 aa  305  8.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  37.44 
 
 		 424 aa  305  9.000000000000001e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 423 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0573  seryl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 425 aa  303  4.0000000000000003e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 422 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 425 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 421 aa  302  9e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 425 aa  301  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 425 aa  300  3e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 428 aa  300  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 425 aa  300  4e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 422 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 431 aa  299  5e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 431 aa  300  5e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 422 aa  299  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  38.39 
 
 		 424 aa  299  8e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 426 aa  298  9e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0842  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  298  1e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  36.95 
 
 		 435 aa  298  1e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 431 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 433 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>