More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0180 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 419 aa  856    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  76.85 
 
 		 445 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  78.95 
 
 		 417 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  78.95 
 
 		 417 aa  638    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  78.95 
 
 		 417 aa  638    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  73.1 
 
 		 421 aa  628  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  74.88 
 
 		 417 aa  629  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  76.13 
 
 		 419 aa  628  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  74.88 
 
 		 419 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  71.36 
 
 		 416 aa  598  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  66.83 
 
 		 418 aa  574  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  67.3 
 
 		 420 aa  571  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  70.45 
 
 		 431 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  68.9 
 
 		 422 aa  558  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  68.33 
 
 		 420 aa  549  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 424 aa  550  1e-155  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  65.96 
 
 		 426 aa  547  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  65.95 
 
 		 436 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  66.51 
 
 		 422 aa  542  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  64.32 
 
 		 426 aa  543  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  65.87 
 
 		 421 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  64.59 
 
 		 425 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  63.72 
 
 		 426 aa  531  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  67.06 
 
 		 422 aa  529  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  64.15 
 
 		 426 aa  523  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  62.95 
 
 		 427 aa  518  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  60.76 
 
 		 428 aa  518  1e-146  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  64.9 
 
 		 423 aa  520  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  63.9 
 
 		 420 aa  519  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  62.77 
 
 		 426 aa  517  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  59.1 
 
 		 428 aa  508  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  61.52 
 
 		 433 aa  507  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  64.29 
 
 		 423 aa  504  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  60.05 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 425 aa  347  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 424 aa  331  2e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 411 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 428 aa  307  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 428 aa  307  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3636  seryl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 413 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000529029 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 424 aa  306  4.0000000000000004e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 425 aa  306  6e-82  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 425 aa  305  7e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 421 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  41.18 
 
 		 425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 		 422 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 422 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 413 aa  299  5e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 423 aa  297  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13891  seryl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  40 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37135  predicted protein  40.52 
 
 		 502 aa  296  3e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000503836  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 423 aa  297  3e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 421 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 421 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 424 aa  296  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 424 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 426 aa  296  7e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  37.41 
 
 		 426 aa  294  2e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 423 aa  293  5e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_516  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 413 aa  292  7e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 420 aa  292  8e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 428 aa  292  9e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 425 aa  292  9e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1433  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00416248  decreased coverage  0.0000798458 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0710  seryl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.102517  normal  0.538462 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0210  seryl-tRNA synthetase  38 
 
 		 417 aa  290  2e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.332279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 424 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 431 aa  290  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 424 aa  290  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 423 aa  290  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1289  seryl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 425 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.265915  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 422 aa  289  7e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 426 aa  289  8e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0577  seryl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  38.42 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13811  seryl-tRNA synthetase  36.47 
 
 		 425 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13601  seryl-tRNA synthetase  36 
 
 		 425 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0349  seryl-tRNA synthetase  35.57 
 
 		 442 aa  286  5.999999999999999e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 425 aa  286  5.999999999999999e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0695  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 426 aa  286  7e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0194542  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 424 aa  285  8e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0594  seryl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 432 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2307  seryl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000241726  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  37.71 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>