More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0210 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0210  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 417 aa  853    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.332279  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0773  seryl-tRNA synthetase  68.82 
 
 		 414 aa  594  1e-169  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.749517  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1189  seryl-tRNA synthetase  68.59 
 
 		 414 aa  595  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1342  seryl-tRNA synthetase  69.3 
 
 		 414 aa  590  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0438  seryl-tRNA synthetase  65.47 
 
 		 411 aa  553  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1569  seryl-tRNA synthetase  65.23 
 
 		 411 aa  553  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0533  seryl-tRNA synthetase  64.75 
 
 		 411 aa  548  1e-155  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0412  seryl-tRNA synthetase  65.23 
 
 		 411 aa  550  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.782708  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1756  seryl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 414 aa  530  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1667  seryl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 417 aa  423  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 421 aa  399  9.999999999999999e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3030  seryl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.134958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 425 aa  398  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  47.13 
 
 		 425 aa  393  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 420 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 469 aa  395  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 426 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2535  seryl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0771698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2665  seryl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873953  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1402  seryl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0953  seryl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.37183 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1477  seryl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  46.46 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1490  seryl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.693524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0957  seryl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 424 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3994  seryl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 422 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 422 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3916  seryl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599878  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0028  seryl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2755  seryl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 426 aa  378  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958971  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1688  seryl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 439 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 432 aa  375  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1795  seryl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.351769  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0453  seryl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.393606  normal  0.0512779 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0441  seryl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 430 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.285362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3853  seryl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1167  seryl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0695975  normal  0.170657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 422 aa  376  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1803  seryl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525065  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  45.15 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3445  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 422 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 427 aa  373  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0628  seryl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0256221  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2772  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521327  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2702  seryl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 436 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.616472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  45.22 
 
 		 431 aa  373  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0637  seryl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 425 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0919244  normal  0.277987 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1850  seryl-tRNA synthetase  45.26 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 433 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1547  seryl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  46.59 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01800  seryl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1503  seryl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 424 aa  374  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000981154 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 433 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0692  seryl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  45.58 
 
 		 433 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  45.41 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  46.95 
 
 		 424 aa  371  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3335  seryl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 444 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1697  seryl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0685581 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3651  seryl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 438 aa  368  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0461818  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>