More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0438 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0438  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 411 aa  844    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1569  seryl-tRNA synthetase  97.57 
 
 		 411 aa  828    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0533  seryl-tRNA synthetase  83.7 
 
 		 411 aa  714    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0412  seryl-tRNA synthetase  98.78 
 
 		 411 aa  834    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.782708  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1756  seryl-tRNA synthetase  65.78 
 
 		 414 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1189  seryl-tRNA synthetase  65.54 
 
 		 414 aa  564  1.0000000000000001e-159  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0773  seryl-tRNA synthetase  65.54 
 
 		 414 aa  559  1e-158  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.749517  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1342  seryl-tRNA synthetase  64.58 
 
 		 414 aa  558  1e-158  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0210  seryl-tRNA synthetase  65.47 
 
 		 417 aa  553  1e-156  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.332279  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1667  seryl-tRNA synthetase  60.48 
 
 		 415 aa  499  1e-140  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 423 aa  408  1.0000000000000001e-112  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 425 aa  403  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 432 aa  393  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 427 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 426 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  46.92 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 422 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 428 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2772  seryl-tRNA synthetase  46 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521327  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 426 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3445  seryl-tRNA synthetase  46 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  45.91 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  47.17 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 439 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 422 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2535  seryl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0771698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3994  seryl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 428 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  48.22 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 424 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3853  seryl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 431 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 422 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1477  seryl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 426 aa  384  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  47.24 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3916  seryl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599878  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 438 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1402  seryl-tRNA synthetase  46.54 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  47 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0180  seryl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 456 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0953  seryl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 468 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.37183 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0957  seryl-tRNA synthetase  44.5 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  45.99 
 
 		 422 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4028  seryl-tRNA synthetase  45.66 
 
 		 443 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  45.07 
 
 		 433 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 426 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1990  seryl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 430 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 421 aa  376  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1278  seryl-tRNA synthetase  45.95 
 
 		 423 aa  376  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.483732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>