More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0533 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0438  seryl-tRNA synthetase  83.7 
 
 		 411 aa  714    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0533  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 411 aa  843    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1569  seryl-tRNA synthetase  83.45 
 
 		 411 aa  717    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0412  seryl-tRNA synthetase  83.94 
 
 		 411 aa  717    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.782708  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1189  seryl-tRNA synthetase  66.99 
 
 		 414 aa  578  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1756  seryl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 414 aa  570  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0773  seryl-tRNA synthetase  64.82 
 
 		 414 aa  558  1e-158  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.749517  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1342  seryl-tRNA synthetase  63.86 
 
 		 414 aa  551  1e-156  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0210  seryl-tRNA synthetase  64.75 
 
 		 417 aa  548  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.332279  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1667  seryl-tRNA synthetase  59.04 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 427 aa  411  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 422 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  48.68 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2535  seryl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 426 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0771698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 422 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 424 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  47.96 
 
 		 425 aa  396  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 428 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 421 aa  395  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 426 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 428 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 438 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1477  seryl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 426 aa  396  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  46.9 
 
 		 426 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1402  seryl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 426 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  48 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 424 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 431 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  47.27 
 
 		 422 aa  388  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  45.52 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 428 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  47.47 
 
 		 423 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0953  seryl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.37183 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 431 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1075  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0171622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1417  seryl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  45.97 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1990  seryl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 431 aa  385  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 423 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 430 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 430 aa  385  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  45.62 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 424 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1844  seryl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0308873  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2755  seryl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958971  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  45.48 
 
 		 426 aa  385  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2772  seryl-tRNA synthetase  46 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521327  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 426 aa  382  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1339  seryl-tRNA synthetase  47.16 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0130081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 426 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1077  seryl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>