More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1667 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1667  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 415 aa  855    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1756  seryl-tRNA synthetase  67.87 
 
 		 414 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1189  seryl-tRNA synthetase  62.08 
 
 		 414 aa  536  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0773  seryl-tRNA synthetase  62.32 
 
 		 414 aa  536  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.749517  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1342  seryl-tRNA synthetase  62.08 
 
 		 414 aa  532  1e-150  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0438  seryl-tRNA synthetase  60.48 
 
 		 411 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1569  seryl-tRNA synthetase  60.24 
 
 		 411 aa  501  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0412  seryl-tRNA synthetase  60.48 
 
 		 411 aa  500  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.782708  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0210  seryl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 417 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.332279  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0533  seryl-tRNA synthetase  59.04 
 
 		 411 aa  483  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  53.48 
 
 		 417 aa  428  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 425 aa  423  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 424 aa  421  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1850  seryl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 423 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1618  seryl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 427 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.697706 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 422 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  51.19 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 424 aa  411  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 426 aa  414  1e-114  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 427 aa  409  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 424 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 424 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 426 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 425 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 422 aa  404  1e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1547  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0886  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.609092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1075  seryl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 429 aa  400  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0171622  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0114  seryl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 418 aa  400  9.999999999999999e-111  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 424 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 433 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 423 aa  398  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 423 aa  398  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 422 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1747  seryl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 428 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.387448  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 427 aa  397  1e-109  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  48.1 
 
 		 425 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 428 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1077  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2755  seryl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 426 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958971  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1028  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1036  seryl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 427 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2195  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000518192  normal  0.265088 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 423 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  49.18 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0968  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1686  seryl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.162047 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  49.18 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  49.42 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  48.72 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>