More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0114 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0114  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 418 aa  861    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 425 aa  450  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  51.55 
 
 		 424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  51.78 
 
 		 424 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 422 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 425 aa  437  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 423 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 427 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 417 aa  433  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 427 aa  431  1e-119  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 424 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  48.69 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  48.44 
 
 		 421 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 428 aa  421  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 429 aa  419  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 425 aa  421  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 424 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 428 aa  417  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 426 aa  415  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 425 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 423 aa  414  1e-114  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 426 aa  410  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 427 aa  411  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 427 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 432 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  48.56 
 
 		 425 aa  411  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  47.38 
 
 		 423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 427 aa  404  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  47.02 
 
 		 422 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 424 aa  398  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 422 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1417  seryl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 430 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  47.97 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1667  seryl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 415 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 422 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2593  seryl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 430 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1616  seryl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 430 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.466666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 430 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  45.9 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1990  seryl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1756  seryl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 414 aa  397  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1159  seryl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 436 aa  398  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0553122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1722  seryl-tRNA synthetase  47.81 
 
 		 431 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 424 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 430 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  47.76 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  47.76 
 
 		 430 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 431 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 426 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  46.1 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  45.75 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0692  seryl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.96441  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 431 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1503  seryl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 424 aa  390  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000981154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>