More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1503 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1503  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 424 aa  869    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000981154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3435  seryl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  53.18 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0642  seryl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.586932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  53.86 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 422 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0940  seryl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.874713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2419  seryl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0500  seryl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0912435  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0979  seryl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 422 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  52.02 
 
 		 425 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2626  seryl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18292  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1986  seryl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 423 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  52.93 
 
 		 433 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 423 aa  440  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0692  seryl-tRNA synthetase  52.58 
 
 		 431 aa  436  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.592025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  52.21 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  51.75 
 
 		 424 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  50.95 
 
 		 422 aa  431  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 422 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3582  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0780205  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  52.01 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 426 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 426 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 426 aa  430  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2692  seryl-tRNA synthetase  52.45 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.730114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  51.03 
 
 		 439 aa  430  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  51.63 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 428 aa  428  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 424 aa  428  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  52.71 
 
 		 424 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 425 aa  429  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1278  seryl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 423 aa  425  1e-118  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.483732  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  52.47 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 424 aa  425  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 424 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 438 aa  421  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 424 aa  423  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 438 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0180  seryl-tRNA synthetase  46.99 
 
 		 456 aa  422  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 432 aa  421  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1339  seryl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 423 aa  424  1e-117  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0130081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 422 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 424 aa  418  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 427 aa  418  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3651  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 438 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0461818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 423 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 426 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1392  seryl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 425 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  50.68 
 
 		 452 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1768  seryl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 430 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.865452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  50.71 
 
 		 422 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 424 aa  418  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 438 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 438 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 426 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 425 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 425 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 421 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 426 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 432 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 427 aa  415  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 426 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 430 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  51.76 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 427 aa  413  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 426 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>