More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1756 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1756  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 414 aa  846    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1667  seryl-tRNA synthetase  67.87 
 
 		 415 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0533  seryl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 411 aa  570  1e-161  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1189  seryl-tRNA synthetase  63.77 
 
 		 414 aa  569  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0773  seryl-tRNA synthetase  64.98 
 
 		 414 aa  564  1e-160  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.749517  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0412  seryl-tRNA synthetase  65.78 
 
 		 411 aa  564  1e-160  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.782708  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0438  seryl-tRNA synthetase  65.78 
 
 		 411 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1569  seryl-tRNA synthetase  65.06 
 
 		 411 aa  560  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1342  seryl-tRNA synthetase  62.32 
 
 		 414 aa  544  1e-154  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0210  seryl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 417 aa  530  1e-149  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.332279  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 417 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  51.56 
 
 		 427 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 427 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  50.84 
 
 		 424 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 424 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  52.28 
 
 		 424 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 422 aa  418  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 428 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 430 aa  415  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  51.32 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 428 aa  413  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  49.52 
 
 		 425 aa  412  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  49.77 
 
 		 438 aa  409  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 421 aa  410  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1077  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 430 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0886  seryl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 429 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.609092 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0968  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.462799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 423 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 432 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0997  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.964875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1062  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  49.76 
 
 		 423 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1028  seryl-tRNA synthetase  50.82 
 
 		 430 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00897  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210113  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2750  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00225777  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  49.19 
 
 		 439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  51.16 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0968  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.246515  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2227  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.495423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2772  seryl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1055  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.208173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2435  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.881624  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00904  hypothetical protein  50.35 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.178726  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1697  seryl-tRNA synthetase  49.28 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0685581 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  52.14 
 
 		 420 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  51.08 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2703  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.48584  normal  0.850161 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0998  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0131648  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3445  seryl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2755  seryl-tRNA synthetase  50.94 
 
 		 426 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.958971  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  48.32 
 
 		 425 aa  404  1e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1547  seryl-tRNA synthetase  50.24 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1686  seryl-tRNA synthetase  49.06 
 
 		 430 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.162047 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 427 aa  405  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1036  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 427 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1666  seryl-tRNA synthetase  49.29 
 
 		 428 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.746595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 427 aa  402  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  50.36 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  50.83 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 423 aa  403  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2353  seryl-tRNA synthetase  48.11 
 
 		 431 aa  399  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  49.4 
 
 		 425 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  51.31 
 
 		 427 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 438 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  50 
 
 		 427 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  51.54 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 423 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0953  seryl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 468 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.37183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1417  seryl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 430 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 426 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2007  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000156378  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1075  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 429 aa  399  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0171622  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  49.17 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>